Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Clip3B9EHT4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clip3B9EHT4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms