Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Otud4B2RRE7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otud4B2RRE7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms