Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Znf518bB2RRE4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Znf518bB2RRE4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Znf518bB2RRE4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Znf518bB2RRE4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Znf518bB2RRE4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Znf518bB2RRE4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Znf518bB2RRE4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Znf518bB2RRE4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Znf518bB2RRE4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Znf518bB2RRE4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Znf518bB2RRE4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms