Protein–RNA interactions for Protein: B1AYN9

Tex28, Testis-expressed 28, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tex28B1AYN9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tex28B1AYN9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tex28B1AYN9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tex28B1AYN9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tex28B1AYN9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tex28B1AYN9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tex28B1AYN9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tex28B1AYN9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tex28B1AYN9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tex28B1AYN9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tex28B1AYN9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tex28B1AYN9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tex28B1AYN9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tex28B1AYN9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tex28B1AYN9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms