Protein–RNA interactions for Protein: B1AVP0

Phactr2, Phosphatase and actin regulator, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr2B1AVP0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Phactr2B1AVP0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phactr2B1AVP0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.4 ms