Protein–RNA interactions for Protein: A6H603

Nwd1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nwd1A6H603 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nwd1A6H603 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nwd1A6H603 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms