Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp8b5A3FIN4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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Atp8b5A3FIN4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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Atp8b5A3FIN4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms