Protein–RNA interactions for Protein: A2BI40

Xlr4a, X-linked lymphocyte-regulated 4A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4aA2BI40 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xlr4aA2BI40 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xlr4aA2BI40 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Xlr4aA2BI40 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xlr4aA2BI40 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xlr4aA2BI40 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xlr4aA2BI40 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xlr4aA2BI40 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xlr4aA2BI40 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xlr4aA2BI40 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Xlr4aA2BI40 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xlr4aA2BI40 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xlr4aA2BI40 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xlr4aA2BI40 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xlr4aA2BI40 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xlr4aA2BI40 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xlr4aA2BI40 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms