Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pramef17A2ASJ1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pramef17A2ASJ1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms