Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tubb1A2AQ07 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tubb1A2AQ07 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms