Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syndig1A2ANU3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Syndig1A2ANU3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms