Protein–RNA interactions for Protein: A2ALW2

Zkscan16, Zinc finger with KRAB and SCAN domains 16, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan16A2ALW2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zkscan16A2ALW2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zkscan16A2ALW2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zkscan16A2ALW2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Zkscan16A2ALW2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zkscan16A2ALW2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zkscan16A2ALW2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zkscan16A2ALW2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Zkscan16A2ALW2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zkscan16A2ALW2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zkscan16A2ALW2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Zkscan16A2ALW2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Zkscan16A2ALW2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zkscan16A2ALW2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zkscan16A2ALW2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Zkscan16A2ALW2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zkscan16A2ALW2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zkscan16A2ALW2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zkscan16A2ALW2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zkscan16A2ALW2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zkscan16A2ALW2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zkscan16A2ALW2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zkscan16A2ALW2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zkscan16A2ALW2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zkscan16A2ALW2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zkscan16A2ALW2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zkscan16A2ALW2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zkscan16A2ALW2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zkscan16A2ALW2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zkscan16A2ALW2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zkscan16A2ALW2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Zkscan16A2ALW2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zkscan16A2ALW2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zkscan16A2ALW2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zkscan16A2ALW2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zkscan16A2ALW2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zkscan16A2ALW2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zkscan16A2ALW2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zkscan16A2ALW2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zkscan16A2ALW2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms