Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SetxA2AKX3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SetxA2AKX3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SetxA2AKX3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SetxA2AKX3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SetxA2AKX3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SetxA2AKX3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SetxA2AKX3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SetxA2AKX3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SetxA2AKX3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SetxA2AKX3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SetxA2AKX3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SetxA2AKX3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SetxA2AKX3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SetxA2AKX3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SetxA2AKX3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SetxA2AKX3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SetxA2AKX3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SetxA2AKX3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SetxA2AKX3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SetxA2AKX3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SetxA2AKX3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SetxA2AKX3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SetxA2AKX3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SetxA2AKX3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SetxA2AKX3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SetxA2AKX3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SetxA2AKX3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SetxA2AKX3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SetxA2AKX3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms