Protein–RNA interactions for Protein: A2AIV2

Virma, Protein virilizer homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VirmaA2AIV2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VirmaA2AIV2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VirmaA2AIV2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms