Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trav12-2A0N8N6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105 ms