Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm36011-201ENSMUST00000208671 2719 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm20547-202ENSMUST00000146299 3893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Tspan8-203ENSMUST00000179196 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 AC124675.1-201ENSMUST00000226263 1390 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1199-203ENSMUST00000131038 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 4933411E06Rik-201ENSMUST00000186016 1493 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Mme-201ENSMUST00000029400 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 AC158605.3-201ENSMUST00000218999 2538 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Igkv4-55-201ENSMUST00000103359 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Igkv6-25-201ENSMUST00000103383 380 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm15571-201ENSMUST00000119887 637 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm14813-201ENSMUST00000122291 395 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s154-201ENSMUST00000122513 108 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm12796-201ENSMUST00000131864 344 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm23432-201ENSMUST00000157181 131 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1381-201ENSMUST00000167248 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Sfta2-202ENSMUST00000174521 649 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm20914-201ENSMUST00000180372 684 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm7456-201ENSMUST00000182862 1011 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 1700019D03Rik-204ENSMUST00000186266 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm29372-201ENSMUST00000191416 364 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 1700063D05Rik-203ENSMUST00000191461 666 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm36961-201ENSMUST00000191980 132 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1398-ps1-201ENSMUST00000193866 929 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm42698-201ENSMUST00000197790 762 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Reg1-203ENSMUST00000204687 904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm38941-201ENSMUST00000208606 529 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm45436-201ENSMUST00000210729 469 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm32842-201ENSMUST00000212653 738 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm35035-201ENSMUST00000218838 628 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm46379-201ENSMUST00000222551 265 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 AC134462.1-201ENSMUST00000223047 552 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 E130119H09Rik-201ENSMUST00000223176 978 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 AC115784.1-201ENSMUST00000227687 1010 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Fabp5-201ENSMUST00000029046 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Olfr13-201ENSMUST00000059512 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Tcl1b1-201ENSMUST00000085043 1040 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Grxcr1-201ENSMUST00000094715 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
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Sft2d1Q5SSN7 Gm37258-201ENSMUST00000191734 1627 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Asic5-202ENSMUST00000107736 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Il15ra-217ENSMUST00000148748 1542 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Adam4-201ENSMUST00000085319 2504 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Pglyrp4-203ENSMUST00000169698 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gngt2-202ENSMUST00000100532 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm14410-201ENSMUST00000108964 912 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Zfp467-207ENSMUST00000114563 463 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Sft2d1Q5SSN7 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
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