Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Mat2a-206ENSMUST00000206692 1400 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm36670-202ENSMUST00000210400 1405 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Scgn-201ENSMUST00000021770 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Lancl1-201ENSMUST00000027149 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 2610042L04Rik-202ENSMUST00000165466 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm20236-201ENSMUST00000193037 4540 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm37094-201ENSMUST00000193352 4540 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Kif16b-203ENSMUST00000211861 4523 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Arhgef15-201ENSMUST00000065040 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Lgi1-206ENSMUST00000198045 1483 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Parvb-201ENSMUST00000023072 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Scn11a-202ENSMUST00000215718 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Prkar1a-202ENSMUST00000106676 962 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Lrrc51-204ENSMUST00000106964 872 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Dhx30-202ENSMUST00000111991 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm11514-201ENSMUST00000117670 432 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm13254-201ENSMUST00000118295 654 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm16418-201ENSMUST00000118577 171 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Rps10-ps4-201ENSMUST00000120308 492 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm13675-201ENSMUST00000120616 529 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm5389-201ENSMUST00000120893 1176 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Pdcl2-202ENSMUST00000122213 1049 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm9498-201ENSMUST00000140849 291 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 1700049E15Rik-202ENSMUST00000152737 921 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm15392-201ENSMUST00000152863 778 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm23021-201ENSMUST00000158765 169 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Tmbim6-205ENSMUST00000160635 871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm17084-201ENSMUST00000163843 511 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Zfp493-203ENSMUST00000181319 730 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 4930568A12Rik-201ENSMUST00000186117 498 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Il24-202ENSMUST00000187650 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm37505-201ENSMUST00000195670 461 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm42529-201ENSMUST00000201843 741 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm44180-201ENSMUST00000203671 408 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm18855-201ENSMUST00000206689 570 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm18877-201ENSMUST00000207706 539 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm45571-201ENSMUST00000209671 569 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 AC139579.1-201ENSMUST00000214560 606 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm7868-201ENSMUST00000223510 680 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Tmem14a-201ENSMUST00000027064 1261 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Tas2r109-201ENSMUST00000067539 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 1700010B08Rik-201ENSMUST00000073081 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm7099-201ENSMUST00000080066 554 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Cst7-201ENSMUST00000089200 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 H2al1j-201ENSMUST00000091180 330 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm826-201ENSMUST00000099127 637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Olfr1057-201ENSMUST00000099892 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Prdm2-201ENSMUST00000105778 7304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Txnrd1-205ENSMUST00000219368 3622 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm38215-201ENSMUST00000192321 2233 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm18422-202ENSMUST00000203798 2214 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Nup98-203ENSMUST00000210682 6694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Ube2d3-201ENSMUST00000106291 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Sulf1-205ENSMUST00000186051 4563 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 Igbp1-201ENSMUST00000033570 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Dclre1b-202ENSMUST00000063502 4113 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Rsrc1-203ENSMUST00000065074 3224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Zfp112-202ENSMUST00000120006 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Mat1a-203ENSMUST00000225720 3468 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm44992-210ENSMUST00000210126 1330 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 AC164092.3-201ENSMUST00000216970 1323 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Xlr4b-202ENSMUST00000069103 1304 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm19719-201ENSMUST00000200934 4230 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 B930095G15Rik-201ENSMUST00000130256 4715 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 P2rx2-206ENSMUST00000200214 1568 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm12002-202ENSMUST00000153794 1803 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm43323-201ENSMUST00000202328 4258 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm11733-201ENSMUST00000092394 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Mbnl3-202ENSMUST00000114875 4649 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm12014-201ENSMUST00000120164 1620 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm42907-201ENSMUST00000199793 2148 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm34280-201ENSMUST00000208250 2114 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm46992-201ENSMUST00000222120 1389 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 5031434C07Rik-201ENSMUST00000053559 2894 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Kdelc1-202ENSMUST00000065767 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 B4galnt3-201ENSMUST00000057283 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Dusp18-202ENSMUST00000109996 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm28469-201ENSMUST00000186374 2166 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm28134-201ENSMUST00000188690 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm37075-201ENSMUST00000191888 2166 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm37574-201ENSMUST00000194264 2166 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Olfml1-201ENSMUST00000120990 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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