Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gcm2-201ENSMUST00000021791 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Vmn1r44-212ENSMUST00000228183 1838 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
SrprbP47758 CR974429.2-201ENSMUST00000221883 1696 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm2065-201ENSMUST00000194697 2757 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Nalcn-201ENSMUST00000000201 7122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm14085-201ENSMUST00000110521 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Plag1-201ENSMUST00000003369 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Mapk10-202ENSMUST00000112846 2617 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm15990-201ENSMUST00000132223 3321 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Lipf-201ENSMUST00000025680 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Dpy19l3-201ENSMUST00000051377 8006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Rad54l-201ENSMUST00000102704 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Vps29-202ENSMUST00000117868 720 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm15763-201ENSMUST00000120136 403 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm12599-201ENSMUST00000120534 792 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Rpain-211ENSMUST00000169965 343 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm4246-201ENSMUST00000172822 216 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Pid1-203ENSMUST00000175996 892 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Spp2-202ENSMUST00000176708 710 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm27177-204ENSMUST00000184491 602 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm20379-201ENSMUST00000188317 1204 ntAPPRIS P1 BASIC8.91□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm28622-201ENSMUST00000189842 507 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Shisa5-207ENSMUST00000197483 534 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm35501-201ENSMUST00000213492 783 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm9249-201ENSMUST00000221420 578 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Ndufa7-201ENSMUST00000048249 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Map3k7-203ENSMUST00000108183 5416 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
SrprbP47758 AC154828.1-201ENSMUST00000220696 2810 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Zfp386-204ENSMUST00000183125 4779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Pik3r4-201ENSMUST00000065778 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Smpd4-204ENSMUST00000163476 4532 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Aqp9-203ENSMUST00000113570 1712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Krr1-203ENSMUST00000163048 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Pcnx4-201ENSMUST00000044352 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Duxbl2-201ENSMUST00000100810 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
SrprbP47758 C1s1-204ENSMUST00000162443 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm37706-201ENSMUST00000195379 2765 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Olfr1361-202ENSMUST00000214321 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm42907-201ENSMUST00000199793 2148 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
SrprbP47758 AC159301.1-202ENSMUST00000225860 2133 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Zfp831-201ENSMUST00000059452 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Med23-201ENSMUST00000020159 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Afap1l2-201ENSMUST00000111584 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Crnn-203ENSMUST00000195515 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Mast4-212ENSMUST00000171791 7647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Zfp14-202ENSMUST00000207072 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Dtwd1-201ENSMUST00000110437 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm24195-201ENSMUST00000116804 137 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm13552-201ENSMUST00000118837 417 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm11838-201ENSMUST00000121999 231 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm25845-201ENSMUST00000122588 310 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Olfr636-ps1-201ENSMUST00000134827 935 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm13658-201ENSMUST00000135329 929 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
SrprbP47758 1700125H03Rik-202ENSMUST00000139265 637 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm26197-201ENSMUST00000175033 115 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm23187-201ENSMUST00000175746 86 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
SrprbP47758 A530083I20Rik-202ENSMUST00000180877 1022 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Ly6e-208ENSMUST00000188042 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm29175-201ENSMUST00000189500 402 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Mllt11-202ENSMUST00000196025 624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm40319-201ENSMUST00000199785 481 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm3776-201ENSMUST00000217203 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Nqo2-204ENSMUST00000222740 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Vmn1r41-204ENSMUST00000227039 985 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
SrprbP47758 4930415O20Rik-201ENSMUST00000023728 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Zscan4b-202ENSMUST00000210847 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Olfr1284-201ENSMUST00000062407 1774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Tars2-203ENSMUST00000098857 3228 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Elf5-201ENSMUST00000028609 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Stard13-202ENSMUST00000110483 5662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Cdh8-207ENSMUST00000155527 3159 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Ift122-203ENSMUST00000112925 4122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Lepr-201ENSMUST00000037552 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Phlpp2-203ENSMUST00000179721 7846 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Pan2-203ENSMUST00000218315 4379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Stox2-202ENSMUST00000110367 3424 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm13083-201ENSMUST00000105773 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
SrprbP47758 4921528I07Rik-202ENSMUST00000213446 3798 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm45634-201ENSMUST00000209736 1990 ntBASIC8.9□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Ctnnd1-224ENSMUST00000111698 5850 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm805-201ENSMUST00000181667 3160 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Ttc9c-202ENSMUST00000096751 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Szt2-201ENSMUST00000075406 10965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm6823-201ENSMUST00000120791 1839 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Tmem245-201ENSMUST00000068792 15981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Tmcc1-203ENSMUST00000172510 2612 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Atf2-201ENSMUST00000055833 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Csmd2-205ENSMUST00000184063 13555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Gm8257-202ENSMUST00000169583 1749 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Olfr1432-202ENSMUST00000207710 2068 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 AC165260.6-204ENSMUST00000225571 3508 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Pwp2-201ENSMUST00000042556 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 Itgae-202ENSMUST00000102537 3825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
SrprbP47758 1700060C20Rik-201ENSMUST00000109506 605 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms