Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Zcwpw2-201ENSMUST00000111769 1505 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Allc-201ENSMUST00000020965 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm28651-202ENSMUST00000227968 2693 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 A630009H07Rik-201ENSMUST00000208485 2159 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 AC153152.1-201ENSMUST00000221105 2742 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 AC135119.1-202ENSMUST00000228435 2203 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Dcx-203ENSMUST00000112851 4095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Vmn1r37-205ENSMUST00000227923 1773 ntAPPRIS P2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Ccl20-202ENSMUST00000113437 794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Aph1b-202ENSMUST00000113730 682 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gps2-203ENSMUST00000116358 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Mir467f-201ENSMUST00000116923 120 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm15047-201ENSMUST00000118891 454 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm13680-201ENSMUST00000119790 793 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm14826-201ENSMUST00000121284 901 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm12223-201ENSMUST00000135468 528 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm28845-201ENSMUST00000144760 733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm11707-201ENSMUST00000150366 490 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm16554-201ENSMUST00000159471 460 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm16334-201ENSMUST00000159488 694 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 S100a10-203ENSMUST00000170612 477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm26784-201ENSMUST00000181666 410 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 1700027F09Rik-201ENSMUST00000189767 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm29477-201ENSMUST00000189860 499 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm28193-201ENSMUST00000189863 615 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Zc2hc1b-201ENSMUST00000019954 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm44203-201ENSMUST00000203134 307 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm45408-201ENSMUST00000211080 390 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm40723-201ENSMUST00000219407 603 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 AC124465.1-201ENSMUST00000222349 746 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 1700001C02Rik-201ENSMUST00000031078 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Mettl21c-201ENSMUST00000061421 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Mir187-201ENSMUST00000083598 61 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm10490-201ENSMUST00000086274 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm37980-201ENSMUST00000194420 1910 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Cd28P31041 1700011H14Rik-201ENSMUST00000022398 1349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Cd28P31041 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Olfr43-202ENSMUST00000205664 2018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Cd28P31041 CU024890.1-201ENSMUST00000221361 2019 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Cd28P31041 AC166159.1-201ENSMUST00000227154 1380 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Myot-202ENSMUST00000115498 2087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Lingo2-202ENSMUST00000098151 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm3139-201ENSMUST00000178330 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm3183-201ENSMUST00000180076 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Kank4os-201ENSMUST00000133455 2251 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Olfr1239-202ENSMUST00000216762 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Fcrl5-204ENSMUST00000193229 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm26720-201ENSMUST00000181260 3538 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Ints9-201ENSMUST00000043914 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Adgrl4-201ENSMUST00000046977 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Olfr76-203ENSMUST00000214676 3175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cd28P31041 3830406C13Rik-206ENSMUST00000223762 2292 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cd28P31041 3110043O21Rik-201ENSMUST00000084724 3413 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm13542-201ENSMUST00000118484 637 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm11763-201ENSMUST00000119964 312 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm5389-201ENSMUST00000120893 1176 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm13495-201ENSMUST00000121156 537 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Pfn2-204ENSMUST00000122210 810 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cd28P31041 1700030A11Rik-201ENSMUST00000125317 888 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Il1rn-205ENSMUST00000142093 321 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cd28P31041 BC049715-202ENSMUST00000163640 744 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Paip1-206ENSMUST00000173627 1233 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Fendrr-201ENSMUST00000181231 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm18800-201ENSMUST00000186588 637 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm7560-201ENSMUST00000187748 873 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms