Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Ankrd6-203ENSMUST00000084749 4573 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Gm14144-201ENSMUST00000128602 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Gm5118-201ENSMUST00000184692 2203 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Gm45237-202ENSMUST00000211157 2452 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 0610037L13Rik-212ENSMUST00000135454 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Ehbp1-207ENSMUST00000180360 4971 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Adgrl2-220ENSMUST00000200543 5509 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Wdr44-202ENSMUST00000101670 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Gm44001-201ENSMUST00000203158 3773 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Mtm1-206ENSMUST00000114621 3257 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Olfr180-203ENSMUST00000206168 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Gm24373-201ENSMUST00000104393 132 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Ccdc163-203ENSMUST00000106463 1159 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Cisd3-202ENSMUST00000107584 546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Gm5406-201ENSMUST00000120054 766 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Anp32b-ps1-201ENSMUST00000122215 758 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Gm11816-202ENSMUST00000149848 714 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Gm26351-201ENSMUST00000157532 232 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 0610012D04Rik-201ENSMUST00000159031 531 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Fundc1-205ENSMUST00000177213 1032 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Gm16596-201ENSMUST00000180576 604 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Mark1-ps3-201ENSMUST00000184922 694 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Gm18033-201ENSMUST00000186678 550 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Gm8307-201ENSMUST00000187682 1150 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Gm28428-201ENSMUST00000188886 697 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 1700029J03Rik-202ENSMUST00000189879 712 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Gm37392-201ENSMUST00000192098 516 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Gm38047-201ENSMUST00000193690 1133 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Gm38337-201ENSMUST00000193986 599 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Gm40040-201ENSMUST00000196123 504 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Gm9729-201ENSMUST00000196364 265 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Igkv8-34-201ENSMUST00000196959 365 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Gm6522-201ENSMUST00000197160 1203 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Gm2287-201ENSMUST00000197417 1084 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Gm42760-201ENSMUST00000199814 311 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Gm43461-201ENSMUST00000202351 996 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Gm44892-201ENSMUST00000208595 488 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Gm44561-201ENSMUST00000208869 264 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Gm3011-201ENSMUST00000215669 582 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Gm19428-202ENSMUST00000220573 1038 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 AC122533.2-201ENSMUST00000223772 545 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 AC165281.1-201ENSMUST00000225713 1011 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 AC114585.2-203ENSMUST00000228400 339 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Mphosph6-201ENSMUST00000034303 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Iba57-202ENSMUST00000069631 864 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Rpl21-ps5-201ENSMUST00000095940 483 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Tmem177-201ENSMUST00000037906 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Narf-201ENSMUST00000103015 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Mtbp-204ENSMUST00000169667 2570 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Phactr4-202ENSMUST00000084249 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Adam18-201ENSMUST00000033957 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Gm8836-201ENSMUST00000198196 1348 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Ift122-202ENSMUST00000112923 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Luzp1-202ENSMUST00000063021 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Chn1os3-201ENSMUST00000147420 2707 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Cldn23Q9D7D7 AC132384.4-201ENSMUST00000220343 1397 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Znfx1-202ENSMUST00000067584 4147 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Gm37706-201ENSMUST00000195379 2765 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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Cldn23Q9D7D7 Proz-201ENSMUST00000033822 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Gm831-201ENSMUST00000149942 4517 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Skint7-204ENSMUST00000163281 1423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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Cldn23Q9D7D7 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Ogdhl-203ENSMUST00000228529 3723 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Gpr55-201ENSMUST00000086975 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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Cldn23Q9D7D7 Gm7534-201ENSMUST00000097849 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Clip4-201ENSMUST00000024854 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Kcnma1-203ENSMUST00000100831 3261 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 F13a1-202ENSMUST00000164727 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Kcnj15-208ENSMUST00000113862 5705 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Ehhadh-201ENSMUST00000023559 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Tex21-201ENSMUST00000021453 2137 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Zfp111-203ENSMUST00000086006 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Mast4-201ENSMUST00000099202 7709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Sh3kbp1-205ENSMUST00000112453 2515 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Trav12-1-201ENSMUST00000103650 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Churc1-202ENSMUST00000110399 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Gm15578-201ENSMUST00000117320 475 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Gm14099-201ENSMUST00000117769 605 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Gm10639-201ENSMUST00000119823 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Gm15836-201ENSMUST00000119952 793 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Gm12525-201ENSMUST00000125412 554 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Gm16330-201ENSMUST00000128324 297 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 A630023P12Rik-201ENSMUST00000129007 1221 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Gm22202-201ENSMUST00000158608 311 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Gm24738-201ENSMUST00000158856 123 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Gm17660-201ENSMUST00000164471 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Zfp661-204ENSMUST00000164551 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cldn23Q9D7D7 Gm22132-201ENSMUST00000175316 100 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms