Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 4921501I09Rik-201ENSMUST00000220337 384 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Olfr1432-202ENSMUST00000207710 2068 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Olfr718-ps1-201ENSMUST00000164536 3962 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Olfr480-202ENSMUST00000217653 1876 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Faf2-203ENSMUST00000126071 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Ppp1r9a-204ENSMUST00000168998 2966 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Tmem268-202ENSMUST00000080336 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Daam1-201ENSMUST00000085299 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Npr3-204ENSMUST00000228489 1969 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Kidins220-202ENSMUST00000220459 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Adamts4-202ENSMUST00000111315 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Sema4d-202ENSMUST00000110039 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Pde2a-204ENSMUST00000209537 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Gm24272-201ENSMUST00000102329 98 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
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PtprtQ99M80 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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PtprtQ99M80 Gm28533-201ENSMUST00000186741 570 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Gm29238-201ENSMUST00000189709 695 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Gm43382-201ENSMUST00000198954 838 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Gm45627-201ENSMUST00000210130 977 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Gm20063-201ENSMUST00000220757 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Defb34-201ENSMUST00000064475 246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Rnase1-201ENSMUST00000080126 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Frmd6-201ENSMUST00000057859 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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PtprtQ99M80 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Usp50-201ENSMUST00000028842 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Zfp185-201ENSMUST00000114546 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Ndufb8-209ENSMUST00000171415 2142 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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PtprtQ99M80 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Gm4894-202ENSMUST00000216428 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 St7-203ENSMUST00000053148 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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PtprtQ99M80 Adam3-201ENSMUST00000033958 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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PtprtQ99M80 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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PtprtQ99M80 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 AV026068-219ENSMUST00000224148 933 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Pla2g2c-202ENSMUST00000105808 3448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Gm17034-201ENSMUST00000168990 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Arf4-202ENSMUST00000112318 1367 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Synj2bp-204ENSMUST00000164431 3305 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Pde8b-210ENSMUST00000162412 4035 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Cfap43-205ENSMUST00000160247 5264 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Fkbp14-201ENSMUST00000046520 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 C87436-202ENSMUST00000113698 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Diexf-201ENSMUST00000085555 5570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprtQ99M80 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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