Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 C330007P06Rik-202ENSMUST00000115248 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Cse1l-201ENSMUST00000002790 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Gm25344-201ENSMUST00000104503 132 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Gimap6-203ENSMUST00000126422 425 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Gm11309-201ENSMUST00000127108 613 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Gm44258-201ENSMUST00000204925 301 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 A930014E10Rik-201ENSMUST00000205115 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Gm45864-201ENSMUST00000211965 1019 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Gm31763-203ENSMUST00000219739 1025 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 AC134468.2-202ENSMUST00000222820 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 AC124103.1-201ENSMUST00000227564 1027 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Glycam1-204ENSMUST00000228895 641 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Kcnma1-206ENSMUST00000163322 3162 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Kcnma1-210ENSMUST00000179836 3177 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Znfx1-202ENSMUST00000067584 4147 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Arhgap21-210ENSMUST00000154230 6972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Rffl-203ENSMUST00000074515 4973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Slmapos2-201ENSMUST00000160089 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Gbp8-201ENSMUST00000031235 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Gm42811-201ENSMUST00000201951 2768 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Tdrd1-201ENSMUST00000078723 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Gm42897-201ENSMUST00000201486 2112 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Tcp10a-201ENSMUST00000095726 2442 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Ctnnd1-211ENSMUST00000111685 5985 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Ctnnd1-215ENSMUST00000111689 5961 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Cdk1-201ENSMUST00000020099 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Gm29128-201ENSMUST00000186448 2858 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Ucp2-202ENSMUST00000126534 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Gm45634-201ENSMUST00000209736 1990 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Elmod2-206ENSMUST00000177594 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Gm44802-201ENSMUST00000208026 1916 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Tyrp1-201ENSMUST00000006151 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Atxn7l1-213ENSMUST00000154742 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Kif3c-204ENSMUST00000219895 2962 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Umps-201ENSMUST00000023510 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Vmn1r176-202ENSMUST00000226319 2930 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Shq1Q7TMX5 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Ablim3-202ENSMUST00000166783 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Shq1Q7TMX5 Eif2ak4-202ENSMUST00000102527 4906 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Cntn2-201ENSMUST00000086521 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Nrxn3-205ENSMUST00000163134 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Shq1Q7TMX5 Gm10130-201ENSMUST00000133235 303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Shq1Q7TMX5 E130111B04Rik-201ENSMUST00000156781 450 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Crip3-206ENSMUST00000165993 735 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Gm29008-201ENSMUST00000189387 298 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Gm38079-201ENSMUST00000195603 154 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
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Shq1Q7TMX5 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
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Shq1Q7TMX5 Srp54a-201ENSMUST00000021407 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Pik3c2g-212ENSMUST00000190962 1774 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Dclk1-207ENSMUST00000198412 4282 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Map4k4-215ENSMUST00000195259 3719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Dock9-206ENSMUST00000212181 7368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Shq1Q7TMX5 Myt1-201ENSMUST00000081125 5327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Epb41l5-203ENSMUST00000163147 3370 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Ndp-201ENSMUST00000040134 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Synj2-201ENSMUST00000061091 4072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Tnfrsf11b-201ENSMUST00000079772 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Gm28068-201ENSMUST00000190861 3503 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Cep162-201ENSMUST00000093802 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Olfr443-ps1-202ENSMUST00000204422 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Perm1-201ENSMUST00000105572 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Olfr15-203ENSMUST00000214590 6240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Ppp1r9a-204ENSMUST00000168998 2966 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Ankrd27-201ENSMUST00000040844 4284 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Eapp-206ENSMUST00000163433 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Ank3-202ENSMUST00000054167 5769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Ndst2-201ENSMUST00000047490 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Naa11-201ENSMUST00000060265 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Gm39244-201ENSMUST00000209663 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Gm20452-201ENSMUST00000174686 513 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Gm28580-201ENSMUST00000186767 88 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 AC069562.1-201ENSMUST00000224206 434 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Cyfip2-202ENSMUST00000093166 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Tnfsf15-201ENSMUST00000062246 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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