Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Rbms2-202ENSMUST00000099139 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 D030047H15Rik-201ENSMUST00000148318 2536 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 Greb1-203ENSMUST00000159120 6346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 Garnl3-202ENSMUST00000102810 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 Olfr1361-202ENSMUST00000214321 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 Igkv12-46-201ENSMUST00000103365 377 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 Ighv11-2-201ENSMUST00000103468 461 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 Tardbp-205ENSMUST00000105700 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 Gm11558-201ENSMUST00000118454 459 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 Gm13521-201ENSMUST00000118922 866 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 Olfr634-ps1-201ENSMUST00000119267 955 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 Trav7n-6-201ENSMUST00000178100 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 Gm26784-201ENSMUST00000181666 410 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 Gm27008-202ENSMUST00000182414 604 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 Mir8095-201ENSMUST00000185103 129 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 Gm37481-201ENSMUST00000195176 403 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 Gm43013-201ENSMUST00000198216 247 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 Gm43346-201ENSMUST00000198290 685 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 Gm42813-201ENSMUST00000200057 615 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 Tex26-207ENSMUST00000202920 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 Gm18765-201ENSMUST00000203166 660 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 1500002F19Rik-203ENSMUST00000211184 375 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 AC131586.4-201ENSMUST00000228424 668 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 Tardbp-203ENSMUST00000095719 1011 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 Vmn1r51-208ENSMUST00000227876 4160 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 Pnliprp1-201ENSMUST00000048644 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 Slc38a1-203ENSMUST00000100262 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 Ehbp1-207ENSMUST00000180360 4971 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 Tenm4-201ENSMUST00000107162 11021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 4933406G16Rik-201ENSMUST00000144854 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 Gria1-204ENSMUST00000151045 5361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 AC164883.2-201ENSMUST00000227931 3815 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 Keg1-201ENSMUST00000025598 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 Gm37022-201ENSMUST00000192517 2254 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 D930007P13Rik-201ENSMUST00000181306 1324 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 Cts7-203ENSMUST00000224986 1349 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 Lama1-201ENSMUST00000035471 9518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 St7-206ENSMUST00000115417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 Lpin1-207ENSMUST00000222989 4103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
P18533 Snapc4-201ENSMUST00000035427 4363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 A730036I17Rik-201ENSMUST00000143346 3431 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Extl2-203ENSMUST00000106502 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Olfr775-202ENSMUST00000214109 3598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Angpt2-201ENSMUST00000033846 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Ank1-213ENSMUST00000141784 6566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Mapk10-202ENSMUST00000112846 2617 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Spata31d1a-202ENSMUST00000224469 1616 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Fnbp1-201ENSMUST00000073879 8469 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Nsun2-201ENSMUST00000022087 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Lrrc51-206ENSMUST00000106966 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Tmsb4x-203ENSMUST00000112176 698 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Mir669e-201ENSMUST00000117003 119 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Gm13742-201ENSMUST00000118805 457 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Gm14016-201ENSMUST00000119095 486 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Dnase1-202ENSMUST00000120009 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Gm13206-201ENSMUST00000129579 1090 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Gm15092-201ENSMUST00000138467 574 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Gm15133-201ENSMUST00000139019 843 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Gm16143-201ENSMUST00000155982 538 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 D330041H03Rik-203ENSMUST00000180579 605 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Gm27458-201ENSMUST00000185108 121 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Gm28888-201ENSMUST00000186556 316 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Gm28341-201ENSMUST00000190883 472 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Cacnb2-216ENSMUST00000195841 503 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Gm18131-201ENSMUST00000199241 449 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Gm31579-201ENSMUST00000203306 966 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Gm9289-201ENSMUST00000221269 606 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Gm5841-201ENSMUST00000195307 2177 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Gm14002-201ENSMUST00000123574 2839 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Etl4-204ENSMUST00000114606 5284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Fmo5-203ENSMUST00000107050 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Polk-210ENSMUST00000222389 1404 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Gabra1-205ENSMUST00000205546 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Tab3-201ENSMUST00000048250 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Csde1-216ENSMUST00000199571 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Sema5a-201ENSMUST00000067458 10809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Zfp207-202ENSMUST00000053740 1562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Aloxe3-201ENSMUST00000021268 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Gm26920-201ENSMUST00000182746 2374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Eps15-204ENSMUST00000132165 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Gm42972-201ENSMUST00000196937 5617 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 CT009515.4-201ENSMUST00000228165 1494 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
P18533 Musk-207ENSMUST00000177951 3352 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
P18533 Musk-204ENSMUST00000098059 3352 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
P18533 Ubr5-204ENSMUST00000226414 8397 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
P18533 Med1-201ENSMUST00000018304 5845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
P18533 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms