Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm6567-201ENSMUST00000205529 2095 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Serpina3k-201ENSMUST00000043058 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm43280-201ENSMUST00000202958 1550 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Cep19-201ENSMUST00000042869 1567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Tmc2-202ENSMUST00000166774 2667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm5442-201ENSMUST00000202121 2034 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Serpina1c-201ENSMUST00000074051 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Zfp37-201ENSMUST00000068822 3494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm29671-201ENSMUST00000189438 2166 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Cstf2t-201ENSMUST00000066039 3750 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Ankrd27-206ENSMUST00000190503 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Zfp939-202ENSMUST00000186855 2480 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Cd36-206ENSMUST00000197890 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Lyg2-201ENSMUST00000078307 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm11870-201ENSMUST00000119255 1322 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Rasef-202ENSMUST00000102837 5158 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm38130-201ENSMUST00000194311 1761 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 AC130219.1-201ENSMUST00000228406 3433 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Mmp19-201ENSMUST00000026411 3402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Tktl1-201ENSMUST00000010127 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Olfr1128-201ENSMUST00000102624 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Sat2-202ENSMUST00000108656 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Rgs19-206ENSMUST00000108778 1427 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Ghrh-202ENSMUST00000109536 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm14048-201ENSMUST00000121864 1268 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm16008-201ENSMUST00000126009 810 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm11534-202ENSMUST00000129261 470 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Snhg17-202ENSMUST00000138592 342 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm26048-201ENSMUST00000157305 142 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm26407-201ENSMUST00000158504 307 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Fcor-201ENSMUST00000159364 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm15833-201ENSMUST00000161563 957 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 U2af1l4-205ENSMUST00000163482 668 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Rgs19-212ENSMUST00000165416 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Vmn2r-ps87-201ENSMUST00000174393 876 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Tdpoz2-201ENSMUST00000191960 1145 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm37247-201ENSMUST00000192549 730 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm4873-201ENSMUST00000199402 1203 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm42472-201ENSMUST00000201626 859 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm45475-201ENSMUST00000209381 309 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 AC153897.1-201ENSMUST00000213510 470 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Olfr209-204ENSMUST00000213779 564 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm29807-201ENSMUST00000220161 372 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm20063-201ENSMUST00000220757 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 AC142227.1-201ENSMUST00000221371 621 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 AC163038.3-201ENSMUST00000223945 558 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Tssk4-206ENSMUST00000228041 1217 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Glycam1-203ENSMUST00000228060 528 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 AW209491-201ENSMUST00000038690 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Fgf1-201ENSMUST00000040647 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Zfp85os-201ENSMUST00000049518 2624 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Cd74-201ENSMUST00000050487 1218 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Olfr1494-201ENSMUST00000051768 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 n-R5s28-201ENSMUST00000082814 119 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm26003-201ENSMUST00000083061 113 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 n-R5s156-201ENSMUST00000083377 105 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Mir486-201ENSMUST00000093576 128 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Zfp280d-217ENSMUST00000184517 3919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Trps1-205ENSMUST00000183997 3627 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 AC105958.1-201ENSMUST00000214783 2144 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm17575-201ENSMUST00000180437 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Xrn2-201ENSMUST00000028921 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Hrh4-201ENSMUST00000041676 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 CT010514.1-201ENSMUST00000214088 2969 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Naalad2-201ENSMUST00000001826 2831 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Tspan8-203ENSMUST00000179196 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 B230364G03Rik-201ENSMUST00000181479 1374 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Slc26a1-201ENSMUST00000051757 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Cmtr2-201ENSMUST00000056972 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Cops2-203ENSMUST00000110463 3392 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Ap3m2-204ENSMUST00000210656 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Grik1-209ENSMUST00000227986 2942 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Rgs4-201ENSMUST00000027991 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 4930402H24Rik-201ENSMUST00000044766 6628 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Nfkbiz-203ENSMUST00000114457 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Adgrf4-204ENSMUST00000170723 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Arhgef3-202ENSMUST00000224981 3618 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Rfx3-204ENSMUST00000172907 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms