Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Bdnf-209ENSMUST00000111050 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Adgrl3-206ENSMUST00000118034 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm13769-202ENSMUST00000214797 2340 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Rpl22-201ENSMUST00000103191 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm12993-201ENSMUST00000119900 479 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 n-R5s76-201ENSMUST00000122700 113 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm14642-201ENSMUST00000147357 470 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm16552-201ENSMUST00000162348 685 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm9286-201ENSMUST00000173586 508 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Tdgf1-ps1-201ENSMUST00000179882 516 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 6530403H02Rik-201ENSMUST00000182099 402 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 C430002N11Rik-204ENSMUST00000190054 443 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm38289-201ENSMUST00000194273 597 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm37929-201ENSMUST00000195116 493 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm40304-201ENSMUST00000202154 268 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm45060-201ENSMUST00000203293 593 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm7424-201ENSMUST00000206919 902 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 2900045O20Rik-201ENSMUST00000218374 1292 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 AC170913.1-201ENSMUST00000221418 758 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 1700028K03Rik-201ENSMUST00000058921 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Wdfy4-201ENSMUST00000061753 9681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Vmn1r37-205ENSMUST00000227923 1773 ntAPPRIS P2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Olfr1361-202ENSMUST00000214321 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Ablim1-201ENSMUST00000079360 7152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 4921509C19Rik-201ENSMUST00000080132 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Mapk1ip1l-201ENSMUST00000164235 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Tex52-202ENSMUST00000130785 1424 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm3139-201ENSMUST00000178330 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm3183-201ENSMUST00000180076 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 AC156645.1-201ENSMUST00000223066 5194 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Cxcr6-201ENSMUST00000049810 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Clcn7-204ENSMUST00000160961 3983 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Zfp106-201ENSMUST00000055241 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Ahi1-202ENSMUST00000163505 2067 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 4933406K04Rik-203ENSMUST00000135423 1391 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm17083-201ENSMUST00000165849 1366 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm7842-201ENSMUST00000217691 1379 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Cd247-209ENSMUST00000187313 2957 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Olfr43-202ENSMUST00000205664 2018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Dbhos-201ENSMUST00000150024 4020 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm14120-201ENSMUST00000129067 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 AC112680.1-201ENSMUST00000215435 1349 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 AC140409.2-201ENSMUST00000216936 3079 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Asap1-215ENSMUST00000177035 3228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 AC155298.3-201ENSMUST00000225307 3220 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Ccdc163-203ENSMUST00000106463 1159 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
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H2-Eb1P04230 Gm16150-201ENSMUST00000127620 437 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm14242-201ENSMUST00000145204 375 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm12930-201ENSMUST00000146679 676 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
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H2-Eb1P04230 1700025H01Rik-201ENSMUST00000187479 547 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
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H2-Eb1P04230 Pglyrp4-201ENSMUST00000047745 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
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H2-Eb1P04230 Gm7275-201ENSMUST00000088296 744 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Olfr1226-201ENSMUST00000099790 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Cenpc1-201ENSMUST00000031170 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Pnlip-201ENSMUST00000057270 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm37783-201ENSMUST00000192025 1856 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Chrnb3-201ENSMUST00000060943 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm12661-201ENSMUST00000118780 3335 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Slc6a19-201ENSMUST00000022048 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Rbm26-204ENSMUST00000163545 3270 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Nipsnap3a-202ENSMUST00000107666 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Pnisr-201ENSMUST00000029911 4545 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Plb1-205ENSMUST00000202201 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Olfr316-202ENSMUST00000215071 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm20547-202ENSMUST00000146299 3893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm11733-201ENSMUST00000092394 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Cnr1-202ENSMUST00000084736 5761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Atf2-201ENSMUST00000055833 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm44116-201ENSMUST00000204269 1525 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Kcnj15-205ENSMUST00000113858 5309 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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