Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Trpm5-201ENSMUST00000009390 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Hal-202ENSMUST00000129421 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Stat6-201ENSMUST00000092074 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Cacna1c-204ENSMUST00000112793 6669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Gm26521-201ENSMUST00000181576 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Sptan1-205ENSMUST00000113719 8018 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Gm44848-201ENSMUST00000207808 3234 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Lpin1-201ENSMUST00000067124 5581 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 A730004F24Rik-202ENSMUST00000195454 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Mctp1-202ENSMUST00000109589 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Taf8-201ENSMUST00000067103 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Sfi1-218ENSMUST00000153425 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Ptchd4-201ENSMUST00000048691 6890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Gm28095-201ENSMUST00000186343 1515 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Gpatch2-202ENSMUST00000065573 4547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Tiam1-201ENSMUST00000002588 7290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Acsl6-203ENSMUST00000072178 2432 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Kcnj5-202ENSMUST00000214223 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 BC016579-201ENSMUST00000036732 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Slfn5-202ENSMUST00000108157 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Pkp1-203ENSMUST00000163260 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Tcrg-C2-201ENSMUST00000103561 914 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Tanc1-208ENSMUST00000139863 7246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Gm371-201ENSMUST00000142240 1245 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Gm15340-201ENSMUST00000144984 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Snora81-201ENSMUST00000157310 178 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Vmn1r126-201ENSMUST00000168398 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 4931429L15Rik-203ENSMUST00000172280 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Gm21978-201ENSMUST00000179696 377 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Gm26988-201ENSMUST00000183296 945 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Gm38008-201ENSMUST00000195333 518 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Gm37113-201ENSMUST00000195675 1157 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Gm3945-201ENSMUST00000196637 683 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Riok3Q9DBU3 Gm43678-201ENSMUST00000197774 328 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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