Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Slc7a8-201ENSMUST00000022787 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Ablim1-203ENSMUST00000104902 5907 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm26638-201ENSMUST00000181762 1924 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Rad54l-201ENSMUST00000102704 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Aloxe3-201ENSMUST00000021268 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Extl2-201ENSMUST00000029575 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Smarca1-203ENSMUST00000101616 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Stxbp5l-205ENSMUST00000114782 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 AC115891.2-201ENSMUST00000218448 1341 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 AC190403.1-201ENSMUST00000224515 1325 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 5430403N17Rik-201ENSMUST00000210717 2553 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Pex5l-209ENSMUST00000193289 3526 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Hypk-202ENSMUST00000110612 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Lca5-201ENSMUST00000034791 4160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gdpgp1-201ENSMUST00000062915 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm15127-202ENSMUST00000101190 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Tomm40l-202ENSMUST00000111326 2753 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Unc93a-201ENSMUST00000084966 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Dhrs7b-202ENSMUST00000108718 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Cep135-201ENSMUST00000049060 5313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm46339-201ENSMUST00000222720 3539 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm36948-201ENSMUST00000194708 3247 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Fam168a-202ENSMUST00000107042 6388 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Zswim2-201ENSMUST00000038223 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gpr83-201ENSMUST00000034408 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Phlpp2-203ENSMUST00000179721 7846 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Bnip3-201ENSMUST00000106112 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Rpl7l1-201ENSMUST00000078286 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Trav15-2-dv6-2-201ENSMUST00000103660 370 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Rab3b-203ENSMUST00000106651 1078 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Olfr1343-ps1-201ENSMUST00000117414 914 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm12250-201ENSMUST00000119467 1274 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm12433-201ENSMUST00000119659 255 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm12067-201ENSMUST00000119755 1148 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm11746-201ENSMUST00000119843 821 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Snhg7os-201ENSMUST00000126798 546 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Fam187b-202ENSMUST00000128384 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm15942-201ENSMUST00000136305 810 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm14651-201ENSMUST00000147192 442 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm14642-201ENSMUST00000147357 470 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Bud31-207ENSMUST00000162594 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm19203-201ENSMUST00000174049 939 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Obox2-203ENSMUST00000174076 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Cdk2ap2-203ENSMUST00000174149 386 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm20463-201ENSMUST00000174756 366 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm8696-201ENSMUST00000174777 385 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm21865-201ENSMUST00000177713 498 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm21170-201ENSMUST00000179330 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Ranbp2-ps2-201ENSMUST00000184379 370 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 4930512B01Rik-202ENSMUST00000188608 983 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm29545-201ENSMUST00000188878 694 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm37994-201ENSMUST00000192124 409 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 5033404E19Rik-201ENSMUST00000192616 630 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm38279-201ENSMUST00000194067 1131 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm34727-201ENSMUST00000195175 529 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm37643-201ENSMUST00000195369 1260 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Prkar2a-206ENSMUST00000195405 1143 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm34144-201ENSMUST00000197039 259 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm30270-201ENSMUST00000202675 524 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm20997-201ENSMUST00000205148 231 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Apoc1-204ENSMUST00000207978 339 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 4930435N07Rik-201ENSMUST00000208065 2127 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Olfr1464-ps1-201ENSMUST00000208760 923 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm34783-201ENSMUST00000209159 303 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm45338-205ENSMUST00000210795 728 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm37797-201ENSMUST00000212114 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 AC161245.1-201ENSMUST00000217207 740 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 4930473H19Rik-202ENSMUST00000222124 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 AC122354.1-201ENSMUST00000222328 702 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm9999-201ENSMUST00000070660 486 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Olfr1415-201ENSMUST00000071521 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Olfr285-201ENSMUST00000079736 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm24145-201ENSMUST00000082631 163 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm26063-201ENSMUST00000083378 107 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Mir195a-201ENSMUST00000083477 94 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Mup16-201ENSMUST00000095051 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Olfr1179-201ENSMUST00000099825 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 4933406C10Rik-202ENSMUST00000181670 1633 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Magea8-201ENSMUST00000070141 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Ttyh1-206ENSMUST00000129423 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Sept2-214ENSMUST00000172165 3192 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Auts2-217ENSMUST00000187544 3166 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 6642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Atg7-202ENSMUST00000169310 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 I830077J02Rik-201ENSMUST00000098758 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Kcna2-202ENSMUST00000196403 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Mep1a-202ENSMUST00000117137 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Phf19-201ENSMUST00000028232 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm26790-201ENSMUST00000181078 2291 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Kidins220-202ENSMUST00000220459 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms