Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Gtpbp6Q3U6U5 Cst12-201ENSMUST00000028932 644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Rab3b-201ENSMUST00000003502 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r26-201ENSMUST00000049694 1020 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Gtpbp6Q3U6U5 Plscr4-201ENSMUST00000034941 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm6639-201ENSMUST00000196349 429 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Gtpbp6Q3U6U5 Iglc1-201ENSMUST00000200568 454 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42931-201ENSMUST00000201009 760 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8774-201ENSMUST00000203621 692 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms