Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Olfr371-202ENSMUST00000218663 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm46313-201ENSMUST00000220463 547 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm5194-201ENSMUST00000221457 742 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Cd28P31041 AC167013.6-201ENSMUST00000226587 1067 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Ubd-201ENSMUST00000038844 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cd28P31041 6030452D12Rik-201ENSMUST00000066875 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Olfr538-202ENSMUST00000210973 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Dppa2-201ENSMUST00000097175 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cd28P31041 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Il15ra-217ENSMUST00000148748 1542 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Sos2-203ENSMUST00000182396 3963 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Pramef12-201ENSMUST00000030326 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Magea10-201ENSMUST00000088481 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm34777-201ENSMUST00000219688 2505 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Mettl6-205ENSMUST00000227777 2762 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm16233-201ENSMUST00000136170 1623 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Tpbpa-201ENSMUST00000021885 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 AC171003.1-201ENSMUST00000221667 1665 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Cyp19a1-203ENSMUST00000215736 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm14226-201ENSMUST00000130870 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Kng2-202ENSMUST00000100046 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm20609-201ENSMUST00000177104 1527 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm44014-201ENSMUST00000205150 1509 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm24542-201ENSMUST00000103870 110 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm23129-201ENSMUST00000104259 132 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm12024-201ENSMUST00000118819 1253 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm12687-201ENSMUST00000119752 706 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm2214-201ENSMUST00000121333 330 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 4930555O08Rik-201ENSMUST00000122821 668 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm16585-201ENSMUST00000161442 610 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm20765-201ENSMUST00000177792 795 ntAPPRIS P2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm21312-201ENSMUST00000179258 795 ntAPPRIS P2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 4930533D04Rik-201ENSMUST00000185478 788 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Scgb2b4-ps-201ENSMUST00000186705 340 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm37247-201ENSMUST00000192549 730 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Cnn3-203ENSMUST00000197135 1242 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm36241-201ENSMUST00000201085 493 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Reg1-203ENSMUST00000204687 904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Klk1b14-ps-201ENSMUST00000206059 777 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Chmp2a-204ENSMUST00000211344 606 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Chmp2a-206ENSMUST00000211626 726 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm32842-201ENSMUST00000212653 738 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 4930442G15Rik-201ENSMUST00000213112 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm33682-201ENSMUST00000222233 256 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 CT009550.2-201ENSMUST00000228851 399 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Prap1-201ENSMUST00000026540 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 n-R5s28-201ENSMUST00000082814 119 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 9330182O14Rik-202ENSMUST00000228780 2053 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 2310069B03Rik-202ENSMUST00000186147 1833 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm37304-201ENSMUST00000193833 2886 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Frmd7-201ENSMUST00000060650 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Entpd3-201ENSMUST00000047687 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm20531-201ENSMUST00000174861 1373 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 A530064D06Rik-202ENSMUST00000053612 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Eps15-204ENSMUST00000132165 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm37210-201ENSMUST00000192484 2004 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cd28P31041 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cd28P31041 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Vmn2r41-201ENSMUST00000168807 3617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Olfr517-202ENSMUST00000216500 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Smok3c-202ENSMUST00000178402 1515 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Nppb-201ENSMUST00000103231 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Cd28P31041 Gm25761-201ENSMUST00000103983 128 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms