Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Gm12967-201ENSMUST00000122147 289 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm8093-203ENSMUST00000144982 1020 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm16103-201ENSMUST00000163003 1279 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 4930533D04Rik-201ENSMUST00000185478 788 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm5541-201ENSMUST00000193248 1113 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm8896-201ENSMUST00000197434 1106 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm42889-201ENSMUST00000199480 660 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm44722-201ENSMUST00000206473 436 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm45463-202ENSMUST00000210735 1188 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm33103-201ENSMUST00000212717 527 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Olfr380-201ENSMUST00000075532 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Prom1-202ENSMUST00000074113 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Veph1-201ENSMUST00000029419 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm6313-202ENSMUST00000150112 2562 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Arsj-201ENSMUST00000093976 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Adgrg1-202ENSMUST00000179619 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Il31ra-206ENSMUST00000224510 2946 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Kcnma1-203ENSMUST00000100831 3261 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Rtl5-201ENSMUST00000113631 4653 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm28403-201ENSMUST00000188743 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm26629-201ENSMUST00000180848 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Ranbp9-208ENSMUST00000222651 1951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gatad2b-203ENSMUST00000197988 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Golga1-201ENSMUST00000039165 4869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 9530053A07Rik-201ENSMUST00000059886 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Vmn1r26-203ENSMUST00000228070 4419 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Rab7b-202ENSMUST00000064679 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Slmapos2-201ENSMUST00000160089 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Naip2-202ENSMUST00000117913 4823 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 1700027J07Rik-203ENSMUST00000217501 1884 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Cbx3-204ENSMUST00000114446 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Lyrm9-203ENSMUST00000147875 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Bicc1-202ENSMUST00000131445 3005 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Nppb-201ENSMUST00000103231 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm2788-201ENSMUST00000129551 797 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 1700123O12Rik-202ENSMUST00000141312 660 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm23077-201ENSMUST00000157854 116 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm9127-201ENSMUST00000188041 985 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm29145-201ENSMUST00000189914 456 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Shisa5-214ENSMUST00000198708 771 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm42804-201ENSMUST00000199701 178 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm8077-201ENSMUST00000209221 1024 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 AC129537.1-202ENSMUST00000226619 430 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 AC124103.1-201ENSMUST00000227564 1027 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm5514-201ENSMUST00000060477 306 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm26264-201ENSMUST00000083278 159 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Slc43a2-201ENSMUST00000042561 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Pgbd1-205ENSMUST00000151743 2642 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Olfr523-204ENSMUST00000214272 3780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Cks1brt-201ENSMUST00000076896 2301 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm12394-201ENSMUST00000107981 3348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Ep400-204ENSMUST00000112436 10685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gdpgp1-201ENSMUST00000062915 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm19325-201ENSMUST00000186238 3382 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm11872-201ENSMUST00000141819 2219 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Pofut1-206ENSMUST00000123487 4143 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Adgrd1-203ENSMUST00000156437 4141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Ccdc114-203ENSMUST00000210602 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Vmn1r176-202ENSMUST00000226319 2930 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Lrrc29-204ENSMUST00000210801 3830 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Birc5-202ENSMUST00000093906 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 C1qtnf7-201ENSMUST00000076939 3879 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm28720-201ENSMUST00000190728 3156 ntBASIC10□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm18697-201ENSMUST00000191179 2126 ntBASIC10□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 A530058O07Rik-201ENSMUST00000222059 3364 ntBASIC10□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm13106-201ENSMUST00000119045 1443 ntBASIC10□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Ctxn3-201ENSMUST00000091892 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Mars2-201ENSMUST00000061334 11294 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm31152-201ENSMUST00000210319 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Spata48-202ENSMUST00000109678 753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm12993-201ENSMUST00000119900 479 ntBASIC10□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm22224-201ENSMUST00000157357 93 ntBASIC10□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm24782-201ENSMUST00000157641 132 ntBASIC10□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Plac1-203ENSMUST00000174390 907 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 1700122H20Rik-201ENSMUST00000188950 421 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm29144-201ENSMUST00000189235 339 ntBASIC10□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm29238-201ENSMUST00000189709 695 ntBASIC10□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm28607-201ENSMUST00000190142 339 ntBASIC10□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm28121-201ENSMUST00000191420 339 ntBASIC10□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm29626-202ENSMUST00000191517 425 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm31881-202ENSMUST00000199455 559 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm43122-201ENSMUST00000201752 354 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 AC120002.1-201ENSMUST00000218456 331 ntBASIC10□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 AC124196.1-201ENSMUST00000225970 1032 ntBASIC10□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 AC122397.3-201ENSMUST00000227097 527 ntBASIC10□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Rnf213-203ENSMUST00000172235 2422 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Mycbpap-202ENSMUST00000093945 3168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Grip1-213ENSMUST00000147454 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Gm37663-201ENSMUST00000191887 2299 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
ScaperF8VQ70 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms