Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gm9553-201ENSMUST00000185703 996 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm29471-201ENSMUST00000190527 700 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm36961-201ENSMUST00000191980 132 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Olfr1389-201ENSMUST00000203369 1073 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm44778-201ENSMUST00000206447 668 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm45338-205ENSMUST00000210795 728 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 AC134462.1-201ENSMUST00000223047 552 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 E130119H09Rik-201ENSMUST00000223176 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 AC131100.1-201ENSMUST00000226328 470 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm5619-201ENSMUST00000071172 760 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Olfr1178-201ENSMUST00000075640 972 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Tcl1b1-201ENSMUST00000085043 1040 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm10335-201ENSMUST00000096020 468 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm10132-201ENSMUST00000099431 468 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm37426-201ENSMUST00000195241 2470 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Olfr1115-203ENSMUST00000214119 2455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Olfr76-202ENSMUST00000213471 3109 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Il15ra-217ENSMUST00000148748 1542 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Enpp4-202ENSMUST00000143137 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Prkacb-201ENSMUST00000005164 4001 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Cep170-201ENSMUST00000057037 6930 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm37168-201ENSMUST00000192965 1452 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm14144-201ENSMUST00000128602 1721 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 4930442J19Rik-202ENSMUST00000157058 1721 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm46430-207ENSMUST00000222254 1703 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Cntn1-204ENSMUST00000169825 5671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Slc25a14-202ENSMUST00000114936 1582 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm18632-201ENSMUST00000222597 2087 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Tmem177-201ENSMUST00000037906 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Psg29-201ENSMUST00000075934 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Nucb2-203ENSMUST00000183175 1913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm18901-201ENSMUST00000197840 1444 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm43869-201ENSMUST00000204742 1405 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm28485-201ENSMUST00000185300 1500 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm28684-201ENSMUST00000185586 1500 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm28422-201ENSMUST00000186112 1500 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm29447-201ENSMUST00000186407 1500 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm29628-201ENSMUST00000187206 1500 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm28316-201ENSMUST00000187576 1500 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm29313-201ENSMUST00000187866 1500 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm28252-201ENSMUST00000188457 1500 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm28950-203ENSMUST00000188826 1500 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm29303-201ENSMUST00000189215 1500 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm28220-201ENSMUST00000189607 1500 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm29342-202ENSMUST00000189689 1500 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm29116-202ENSMUST00000189963 1500 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm29081-203ENSMUST00000190140 1500 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm28726-201ENSMUST00000190994 1500 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm29386-203ENSMUST00000191185 1500 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm33954-202ENSMUST00000195188 1500 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Senp6-203ENSMUST00000165607 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gngt2-202ENSMUST00000100532 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Ighv14-2-201ENSMUST00000103467 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Defb20-201ENSMUST00000109836 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Zfp467-207ENSMUST00000114563 463 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gps2-203ENSMUST00000116358 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm14561-201ENSMUST00000117376 798 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Atp5k-202ENSMUST00000118632 272 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm12955-201ENSMUST00000119689 957 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm15571-201ENSMUST00000119887 637 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm11605-201ENSMUST00000120413 646 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Mir7011-201ENSMUST00000183768 73 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm37678-201ENSMUST00000192908 1146 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Cnn3-203ENSMUST00000197135 1242 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm43743-201ENSMUST00000197898 697 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm6308-201ENSMUST00000203226 313 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Olfr977-ps1-201ENSMUST00000217438 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm30709-202ENSMUST00000222476 956 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Psg19-201ENSMUST00000004657 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Atp5k-201ENSMUST00000049628 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Trap1a-201ENSMUST00000054534 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Olfr543-201ENSMUST00000061482 1130 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Olfr2-201ENSMUST00000094109 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
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