Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Tnfrsf23-202ENSMUST00000152703 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Plcg2-201ENSMUST00000081232 4298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 AC158799.1-204ENSMUST00000217441 1321 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Ap3b2-201ENSMUST00000082090 3804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Prox2-202ENSMUST00000177289 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Npr3-204ENSMUST00000228489 1969 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gimap4-202ENSMUST00000090070 1804 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gng7-204ENSMUST00000118233 3433 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Mef2a-204ENSMUST00000107476 4759 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42444-201ENSMUST00000199366 4558 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc77-201ENSMUST00000032283 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Cdkal1-201ENSMUST00000006353 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Ola1-203ENSMUST00000112055 1251 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12955-201ENSMUST00000119689 957 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Nr1i3-208ENSMUST00000155126 2980 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 1700027F09Rik-201ENSMUST00000189767 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 CT010453.2-201ENSMUST00000227005 483 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Stau1-202ENSMUST00000109235 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Mapre2-209ENSMUST00000170802 3936 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Oas1e-203ENSMUST00000201172 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Parpbp-201ENSMUST00000048518 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6368-201ENSMUST00000119727 2147 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Prkcz-202ENSMUST00000103178 4083 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Nedd4-209ENSMUST00000184450 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 A730085K08Rik-201ENSMUST00000177015 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Aoc3-202ENSMUST00000103105 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Dis3l-202ENSMUST00000113890 3224 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Dab1-201ENSMUST00000106826 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21614-201ENSMUST00000183260 1005 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Adgrg4-201ENSMUST00000096431 1137 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gsap-201ENSMUST00000036031 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Runx1t1-203ENSMUST00000098257 2332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Emsy-201ENSMUST00000038359 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Cacng5-202ENSMUST00000106742 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Emc1-205ENSMUST00000179784 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Irf4-202ENSMUST00000110307 4761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Irf4-201ENSMUST00000021784 4764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 AC093043.2-201ENSMUST00000228616 2017 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Phc1-201ENSMUST00000079560 3839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufb8-209ENSMUST00000171415 2142 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Itgb6-203ENSMUST00000112517 3537 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Hsf2bp-201ENSMUST00000002145 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42700-201ENSMUST00000199071 2437 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr433-202ENSMUST00000214690 2968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gfm2-209ENSMUST00000161825 4416 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Pcdhb8-201ENSMUST00000051163 3334 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Ablim1-212ENSMUST00000111558 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Arf4-202ENSMUST00000112318 1367 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Syn3-201ENSMUST00000120638 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43196-201ENSMUST00000201762 2114 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Ggt5-201ENSMUST00000072217 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp4r1l-ps-205ENSMUST00000141051 4466 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr48-205ENSMUST00000215307 3776 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12183-201ENSMUST00000120566 1848 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29354-201ENSMUST00000187613 696 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18797-201ENSMUST00000190809 1174 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rb1cc1Q9ESK9 AL671874.1-201ENSMUST00000223746 1123 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms