Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Dusp3-206ENSMUST00000151678 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Slc6a19-201ENSMUST00000022048 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gucy1a3-201ENSMUST00000048976 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm15509-201ENSMUST00000162615 2162 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Oat-201ENSMUST00000084500 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm42837-201ENSMUST00000197071 2829 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm34297-201ENSMUST00000218569 1980 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Fam126b-202ENSMUST00000097724 4581 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm43681-201ENSMUST00000201581 1903 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Ighv1-72-201ENSMUST00000103541 396 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Aph1b-202ENSMUST00000113730 682 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm13526-201ENSMUST00000117970 189 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm14519-201ENSMUST00000118490 312 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm11922-201ENSMUST00000118967 475 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm5761-201ENSMUST00000119238 834 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Bdh2-202ENSMUST00000120397 1172 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm12223-201ENSMUST00000135468 528 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Kcnab3os-201ENSMUST00000136196 566 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 E330017L17Rik-202ENSMUST00000139190 861 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm4473-201ENSMUST00000145987 657 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm20452-201ENSMUST00000174686 513 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r-ps52-201ENSMUST00000176211 612 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm21917-203ENSMUST00000180309 561 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm18797-201ENSMUST00000190809 1174 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm36961-201ENSMUST00000191980 132 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 A930014E10Rik-201ENSMUST00000205115 546 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 4930442G15Rik-201ENSMUST00000213112 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm8948-201ENSMUST00000216371 370 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 AC159312.1-201ENSMUST00000221508 856 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Prap1-201ENSMUST00000026540 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Trap1a-201ENSMUST00000054534 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm26132-201ENSMUST00000083166 148 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Snora57-201ENSMUST00000093658 148 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gimap4-202ENSMUST00000090070 1804 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 CT010514.1-201ENSMUST00000214088 2969 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Phactr4-202ENSMUST00000084249 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 9030607J07Rik-201ENSMUST00000202228 1622 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Atxn7l1-208ENSMUST00000136644 3155 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Cxcl5-201ENSMUST00000031318 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Ddb1-201ENSMUST00000025649 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Grip1-204ENSMUST00000105261 3608 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r196-203ENSMUST00000227516 5122 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm37210-201ENSMUST00000192484 2004 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 R3hdm2-204ENSMUST00000105250 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Hipk1-202ENSMUST00000106845 3967 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Mpzl3-203ENSMUST00000114664 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Pcm1-204ENSMUST00000211247 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 A630001G21Rik-201ENSMUST00000064788 1353 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Nrcam-201ENSMUST00000020939 4469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 4921509C19Rik-201ENSMUST00000080132 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Zranb1-201ENSMUST00000033265 2210 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm28906-201ENSMUST00000191371 1779 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Fcgr3-201ENSMUST00000164044 1347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Cep97-201ENSMUST00000023270 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Senp6-203ENSMUST00000165607 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm17552-201ENSMUST00000181211 3877 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Trav12-1-201ENSMUST00000103650 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Tmsb15a-202ENSMUST00000113154 544 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm12144-201ENSMUST00000136288 1292 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 1810062O18Rik-204ENSMUST00000141265 751 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm13833-201ENSMUST00000146766 719 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Nhej1-201ENSMUST00000152855 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm17171-201ENSMUST00000168048 534 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm43607-201ENSMUST00000199524 336 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Zc2hc1b-201ENSMUST00000019954 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm32921-201ENSMUST00000200592 810 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm43690-201ENSMUST00000201213 266 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm3604-203ENSMUST00000202194 736 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 1600020E01Rik-203ENSMUST00000204008 713 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Klk1b14-ps-201ENSMUST00000206059 777 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm2734-201ENSMUST00000208561 743 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms