Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Rimklb-206ENSMUST00000204731 3039 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Plcg2-201ENSMUST00000081232 4298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gm37552-201ENSMUST00000193939 2520 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Heatr6-201ENSMUST00000001002 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Olfr225-202ENSMUST00000213169 2658 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gm18537-202ENSMUST00000206215 1503 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Ppip5k1-201ENSMUST00000052029 5533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gsdmc3-201ENSMUST00000089894 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Cd44-206ENSMUST00000111192 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gpatch2-206ENSMUST00000160471 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gm9125-201ENSMUST00000178458 2233 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Ggt5-201ENSMUST00000072217 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gabrb3-206ENSMUST00000196198 4348 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Frrs1-201ENSMUST00000040260 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gm44090-201ENSMUST00000204669 1834 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gm29385-201ENSMUST00000186831 363 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprkP35822 AC156559.2-201ENSMUST00000224403 384 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gm34730-201ENSMUST00000210674 4077 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Cd300lb-203ENSMUST00000149663 2641 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Runx1t1-203ENSMUST00000098257 2332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gm43660-201ENSMUST00000200956 6548 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Clec1a-201ENSMUST00000037481 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Prkcz-202ENSMUST00000103178 4083 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Prkd3-202ENSMUST00000118768 2847 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Kpna6-202ENSMUST00000102590 5710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gm43071-201ENSMUST00000197233 2032 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Rian-202ENSMUST00000181253 2355 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gm8995-202ENSMUST00000208417 3490 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprkP35822 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Mcf2l-208ENSMUST00000110879 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Ambn-201ENSMUST00000031226 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gm13430-201ENSMUST00000121366 288 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gm6004-201ENSMUST00000173237 1116 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprkP35822 1700027F09Rik-201ENSMUST00000189767 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gm35021-202ENSMUST00000210289 961 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprkP35822 AC124537.2-201ENSMUST00000220872 883 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Nutm1-201ENSMUST00000043970 3731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Pex5l-210ENSMUST00000193681 3620 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Phf21a-204ENSMUST00000111290 6332 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Phf21a-203ENSMUST00000090586 6310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Celf2-223ENSMUST00000182851 3587 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Sh3pxd2b-201ENSMUST00000038753 7413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Tnfrsf23-202ENSMUST00000152703 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprkP35822 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprkP35822 Atxn7l1-201ENSMUST00000077456 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Nufip1-201ENSMUST00000022586 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Dhx30-204ENSMUST00000196171 3885 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Abca8a-202ENSMUST00000100287 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Abca8a-204ENSMUST00000106664 5617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Me1-202ENSMUST00000185374 3292 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Olfr1062-201ENSMUST00000105213 956 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm16336-201ENSMUST00000126011 380 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprkP35822 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm24050-201ENSMUST00000158623 290 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm10177-201ENSMUST00000160052 444 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprkP35822 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Olfr1337-201ENSMUST00000077247 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Slc2a3-201ENSMUST00000032476 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gpatch2-202ENSMUST00000065573 4547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 D630033O11Rik-205ENSMUST00000210802 2761 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Nedd4-209ENSMUST00000184450 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm16433-201ENSMUST00000062429 1984 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
PtprkP35822 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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