Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm45408-201ENSMUST00000211080 390 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 AC124712.1-201ENSMUST00000221833 445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 CT009550.3-201ENSMUST00000228542 455 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gng2-201ENSMUST00000055100 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 Olfr2-201ENSMUST00000094109 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 Olfr155-201ENSMUST00000095108 1172 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm34184-201ENSMUST00000216477 2713 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 Pglyrp4-203ENSMUST00000169698 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm805-201ENSMUST00000181667 3160 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 Efhb-201ENSMUST00000024725 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 Zfp207-203ENSMUST00000108216 2152 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 Kcnma1-224ENSMUST00000224077 3537 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 Ehhadh-201ENSMUST00000023559 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 Pknox2-207ENSMUST00000177218 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 Phc3-210ENSMUST00000177992 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm44752-201ENSMUST00000207140 3305 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 Olfr466-202ENSMUST00000214214 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 Olfr650-ps1-201ENSMUST00000121432 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 Mef2c-222ENSMUST00000199019 4441 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 Tmc2-202ENSMUST00000166774 2667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 Olfr97-206ENSMUST00000216225 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 Lyg2-201ENSMUST00000078307 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 Serpina1d-201ENSMUST00000078869 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 Zfp474-202ENSMUST00000209270 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gfral-201ENSMUST00000074880 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm42576-201ENSMUST00000202336 2846 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 AL589871.1-201ENSMUST00000221299 3561 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 Eml1-201ENSMUST00000054955 3879 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm16427-203ENSMUST00000201432 2042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 Zfp661-202ENSMUST00000110366 4912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 Ighj1-201ENSMUST00000103430 53 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm23946-201ENSMUST00000104423 197 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm6181-201ENSMUST00000117187 264 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 S100a10-203ENSMUST00000170612 477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm26436-201ENSMUST00000180325 132 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 4930533D04Rik-201ENSMUST00000185478 788 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm37371-201ENSMUST00000194837 392 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm42775-201ENSMUST00000198407 740 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm43805-201ENSMUST00000198488 824 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm17977-201ENSMUST00000198743 574 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 4930557K07Rik-201ENSMUST00000205110 363 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm44721-201ENSMUST00000206978 472 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm45255-201ENSMUST00000209943 811 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 AL645704.1-201ENSMUST00000221642 604 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 CT009733.1-202ENSMUST00000224941 441 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 Apoc2-201ENSMUST00000003074 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 Llcfc1-201ENSMUST00000031900 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 Tdgf1-ps2-201ENSMUST00000074412 505 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 Olfr1504-201ENSMUST00000078282 1085 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 Olfr641-201ENSMUST00000098183 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 Nrcam-201ENSMUST00000020939 4469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm44187-201ENSMUST00000204735 1929 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 Trrap-215ENSMUST00000213013 12398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm42546-201ENSMUST00000201584 2592 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 Mr1-201ENSMUST00000027744 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 Zfyve9-201ENSMUST00000042185 2170 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 Nxpe4-201ENSMUST00000093853 3173 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 Phactr2-204ENSMUST00000105546 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 Dph6-202ENSMUST00000055144 2476 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 Ank3-207ENSMUST00000181974 3751 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 Ptprg-202ENSMUST00000119888 2787 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 Lpcat2b-201ENSMUST00000166599 2782 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 AC132465.2-201ENSMUST00000218673 2728 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
RxraP28700 Tex52-202ENSMUST00000130785 1424 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Phactr4-202ENSMUST00000084249 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Sept14-203ENSMUST00000182386 1642 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Oas1e-203ENSMUST00000201172 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Zfp473-207ENSMUST00000149011 9230 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm43211-201ENSMUST00000196901 1899 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Olfr1393-202ENSMUST00000213323 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm37877-201ENSMUST00000191630 2709 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm16409-201ENSMUST00000100510 747 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm26429-201ENSMUST00000104829 110 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm5915-201ENSMUST00000116136 454 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm12310-201ENSMUST00000118013 492 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Rps6-ps4-201ENSMUST00000118499 750 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm9143-201ENSMUST00000120745 745 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm8172-201ENSMUST00000120762 750 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Cyp4a30-ps-201ENSMUST00000120813 1020 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm6689-201ENSMUST00000130905 481 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm20500-201ENSMUST00000174621 321 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Mir6999-201ENSMUST00000183498 61 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm27675-201ENSMUST00000184527 94 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm28140-201ENSMUST00000190148 1271 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm42464-201ENSMUST00000196717 417 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm42861-201ENSMUST00000199596 634 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm44451-201ENSMUST00000203767 483 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
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