Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Met-201ENSMUST00000080469 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 B230303O12Rik-201ENSMUST00000199119 3645 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Rps19-ps2-201ENSMUST00000100614 438 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm14561-201ENSMUST00000117376 798 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm5742-201ENSMUST00000120764 505 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm15989-201ENSMUST00000121895 498 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Tle6-213ENSMUST00000151858 627 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 A230009B12Rik-201ENSMUST00000159422 898 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Glyatl3-201ENSMUST00000166343 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Rps19-ps1-201ENSMUST00000168472 438 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm4246-201ENSMUST00000172822 216 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm24327-201ENSMUST00000175108 78 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Rps19-ps5-201ENSMUST00000180745 403 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Rps19-ps6-201ENSMUST00000181233 438 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Mir6415-201ENSMUST00000184064 100 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm18821-201ENSMUST00000184135 709 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm8870-201ENSMUST00000188170 775 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm9120-201ENSMUST00000190835 994 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm29068-201ENSMUST00000191607 400 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm36398-201ENSMUST00000192255 696 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm30312-201ENSMUST00000194516 696 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Tmigd3-206ENSMUST00000199977 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 4930557J02Rik-201ENSMUST00000202325 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm42903-201ENSMUST00000202607 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm31579-201ENSMUST00000203306 966 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm44694-201ENSMUST00000205317 1298 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Klk1b14-ps-201ENSMUST00000206059 777 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm7482-201ENSMUST00000206446 505 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm5654-201ENSMUST00000217787 475 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 AC153937.3-201ENSMUST00000217814 706 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm35514-201ENSMUST00000221615 352 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 CT025603.3-201ENSMUST00000224031 419 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 AC165260.3-201ENSMUST00000225101 665 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Reg2-201ENSMUST00000023906 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Oard1-201ENSMUST00000046651 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Olfr514-201ENSMUST00000084754 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Scn8a-202ENSMUST00000096198 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Birc5-202ENSMUST00000093906 3334 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Hsdl2-202ENSMUST00000107528 2626 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Mndal-201ENSMUST00000111210 1907 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Xpnpep2-201ENSMUST00000077775 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Rbx1-201ENSMUST00000023036 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Psg18-201ENSMUST00000003597 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 C87977-202ENSMUST00000105754 1407 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm6418-201ENSMUST00000118325 3577 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Stx8-202ENSMUST00000021286 1638 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 AC117656.3-203ENSMUST00000225007 1809 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Nudt7-202ENSMUST00000073521 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm17034-201ENSMUST00000168990 2229 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Umps-201ENSMUST00000023510 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Ccr4-201ENSMUST00000054414 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Serping1-201ENSMUST00000023994 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Wdr5b-201ENSMUST00000042203 1784 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Mllt3-202ENSMUST00000126353 1956 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Rorc-202ENSMUST00000197040 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm7942-201ENSMUST00000163216 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Tm4sf20-201ENSMUST00000027331 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Aspa-206ENSMUST00000184572 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gpr1-201ENSMUST00000050536 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Olfr1497-202ENSMUST00000217384 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm11868-201ENSMUST00000121594 1478 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm25502-201ENSMUST00000104428 131 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Parp11-204ENSMUST00000112195 733 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm41-201ENSMUST00000116183 1023 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm15516-201ENSMUST00000117292 193 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm15062-201ENSMUST00000120567 367 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm13633-201ENSMUST00000120668 898 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm14414-201ENSMUST00000120833 573 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm11604-201ENSMUST00000121487 742 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Defa-ps10-201ENSMUST00000121649 171 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Rpl36-ps2-201ENSMUST00000136893 311 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Defa-ps3-201ENSMUST00000142705 282 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 E130215H24Rik-201ENSMUST00000145525 939 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 1700034H15Rik-205ENSMUST00000154116 926 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 4933400F21Rik-201ENSMUST00000186098 1007 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm29548-201ENSMUST00000187012 694 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 Gm28105-201ENSMUST00000187788 694 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Vpreb2P13373 1700124L16Rik-203ENSMUST00000190077 1110 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms