Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm42514-201ENSMUST00000196636 1832 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm15318-202ENSMUST00000146320 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Olfr180-203ENSMUST00000206168 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 C130083A15Rik-201ENSMUST00000205707 1460 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Sox5-201ENSMUST00000038815 7243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Phf11a-201ENSMUST00000062307 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Atp2b4-207ENSMUST00000165602 8101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Znhit3-201ENSMUST00000103195 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Igkv8-27-201ENSMUST00000103381 300 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Uqcrq-202ENSMUST00000109019 504 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm11997-201ENSMUST00000118697 313 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm13495-201ENSMUST00000121156 537 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Pfn2-204ENSMUST00000122210 810 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm15736-201ENSMUST00000141710 420 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm8813-201ENSMUST00000155930 595 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 1500004A13Rik-201ENSMUST00000183374 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Mir6999-201ENSMUST00000183498 61 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm5835-201ENSMUST00000185806 1270 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 H2al1a-201ENSMUST00000188439 501 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 1700027F09Rik-201ENSMUST00000189767 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Tmem265-202ENSMUST00000190278 587 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm42861-201ENSMUST00000199596 634 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 1700021F13Rik-202ENSMUST00000202665 469 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm44725-201ENSMUST00000205307 391 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm44743-201ENSMUST00000209062 386 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm8667-201ENSMUST00000211112 449 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 AC152946.3-201ENSMUST00000219424 280 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm18504-201ENSMUST00000220917 929 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 AC207128.1-201ENSMUST00000225928 799 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Capsl-201ENSMUST00000042360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Olfr1445-201ENSMUST00000049624 1001 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Mme-201ENSMUST00000029400 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Ica1l-206ENSMUST00000191251 3415 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm43792-201ENSMUST00000202492 2210 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm44669-201ENSMUST00000207774 1969 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm45634-201ENSMUST00000209736 1990 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Fto-204ENSMUST00000136802 3751 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm28906-201ENSMUST00000191371 1779 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm43618-201ENSMUST00000197392 3451 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Olfr122-202ENSMUST00000172582 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Sept11-203ENSMUST00000201421 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Erg-202ENSMUST00000113846 3249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Smim17-202ENSMUST00000160218 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Mlh3-201ENSMUST00000019378 5463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gfpt1-204ENSMUST00000113658 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Hepacam2-201ENSMUST00000049985 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Oas2-201ENSMUST00000053909 3869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 AC132596.1-201ENSMUST00000223043 2263 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Zmym1-201ENSMUST00000055013 3001 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Trp53cor1-201ENSMUST00000133221 2956 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Ccser1-201ENSMUST00000045522 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm29601-201ENSMUST00000187961 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Celf5-204ENSMUST00000120856 3861 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Deup1-201ENSMUST00000045513 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Nrcam-201ENSMUST00000020939 4469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Zfx-202ENSMUST00000113925 879 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Dppa3-ps-201ENSMUST00000116499 451 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Tpi-rs8-201ENSMUST00000120382 708 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Wdr61-205ENSMUST00000130368 1162 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm12976-201ENSMUST00000150171 459 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Fbxl12-210ENSMUST00000155301 476 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm27680-202ENSMUST00000199221 807 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm43235-201ENSMUST00000200121 297 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Iglc1-201ENSMUST00000200568 454 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm36241-201ENSMUST00000201085 493 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm4536-201ENSMUST00000209157 542 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 AC132384.1-201ENSMUST00000219908 1195 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 AC142114.1-201ENSMUST00000227724 328 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 CT009550.3-201ENSMUST00000228542 455 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Wdr61-201ENSMUST00000051822 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm25129-201ENSMUST00000082651 133 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Mphosph9-211ENSMUST00000184951 5008 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gprasp1-203ENSMUST00000113147 5611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm6284-201ENSMUST00000209609 4287 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 St7-203ENSMUST00000053148 2288 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Arl15-201ENSMUST00000091201 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Ugt3a1-201ENSMUST00000022861 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Med12l-204ENSMUST00000164225 10264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Dtna-202ENSMUST00000115832 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 1810013D15Rik-203ENSMUST00000196971 1450 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Anxa9-201ENSMUST00000015846 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Rdx-203ENSMUST00000163153 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
H2-Eb1P04230 Olfr1320-203ENSMUST00000214375 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms