Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Angpt2-201ENSMUST00000033846 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm45017-201ENSMUST00000206842 1777 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 D030068K23Rik-204ENSMUST00000212085 1351 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Pcdh9-201ENSMUST00000068992 3714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gphn-202ENSMUST00000110388 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Cebpz-201ENSMUST00000024885 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 A530017D24Rik-201ENSMUST00000101077 2315 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm42603-201ENSMUST00000199893 2146 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Ncald-203ENSMUST00000119730 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm37980-201ENSMUST00000194420 1910 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Olfr449-204ENSMUST00000214687 1921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 3830406C13Rik-201ENSMUST00000112669 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Kdm4c-201ENSMUST00000030102 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm4951-201ENSMUST00000031549 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Olfr1232-202ENSMUST00000213860 2413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm5721-201ENSMUST00000119845 1696 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm4961-201ENSMUST00000197982 2249 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Glcci1-202ENSMUST00000161217 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Peak1-204ENSMUST00000188142 7524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Rufy3-201ENSMUST00000031229 4049 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gimap4-202ENSMUST00000090070 1804 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm23358-201ENSMUST00000103887 110 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm22150-201ENSMUST00000104447 135 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Rnf170-203ENSMUST00000110575 966 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm15209-201ENSMUST00000117703 400 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm25320-201ENSMUST00000122551 324 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm12811-201ENSMUST00000125237 667 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm12594-201ENSMUST00000132140 499 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 4930439A04Rik-201ENSMUST00000137241 739 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Crem-218ENSMUST00000139537 807 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Pabpn1-203ENSMUST00000139985 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 1810062O18Rik-204ENSMUST00000141265 751 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm11551-201ENSMUST00000147438 410 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Mir1932-201ENSMUST00000157390 90 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm23663-201ENSMUST00000158045 80 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm24347-201ENSMUST00000158711 142 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm6098-201ENSMUST00000180234 330 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm27288-201ENSMUST00000184215 80 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm27597-201ENSMUST00000184365 80 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm27506-201ENSMUST00000184558 80 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm27529-201ENSMUST00000184975 80 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm27907-201ENSMUST00000185101 80 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 9330159M07Rik-204ENSMUST00000188156 737 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 4930448I18Rik-201ENSMUST00000197958 736 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Rnf212-206ENSMUST00000212212 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm34006-201ENSMUST00000213985 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm39456-201ENSMUST00000214759 1019 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm40421-201ENSMUST00000218991 658 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm46317-201ENSMUST00000221103 393 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 AC131745.3-201ENSMUST00000223582 554 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 AC163660.3-202ENSMUST00000224917 464 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 CT009550.2-201ENSMUST00000228851 399 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Capsl-201ENSMUST00000042360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Olfr1445-201ENSMUST00000049624 1001 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Olfr1255-201ENSMUST00000057369 933 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm10015-201ENSMUST00000072570 465 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Ube2e2-201ENSMUST00000076133 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 4932414J04Rik-201ENSMUST00000152483 3059 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Nsun7-201ENSMUST00000031109 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Olfr1115-203ENSMUST00000214119 2455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm38099-201ENSMUST00000193280 3170 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Ggta1-204ENSMUST00000113001 3340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm44141-201ENSMUST00000204231 1583 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm2065-201ENSMUST00000194697 2757 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Tspan8-203ENSMUST00000179196 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Phf11a-201ENSMUST00000062307 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm5118-201ENSMUST00000184692 2203 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Itk-203ENSMUST00000109237 4268 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Garnl3-202ENSMUST00000102810 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 E430024I08Rik-202ENSMUST00000220632 1513 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Maats1-202ENSMUST00000114740 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Olfr305-203ENSMUST00000213869 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Olfr1497-202ENSMUST00000217384 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm6820-201ENSMUST00000188803 2173 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Zfp52-201ENSMUST00000079242 2175 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Itgam-202ENSMUST00000106240 3325 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Cntn5-204ENSMUST00000162484 3606 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm36950-201ENSMUST00000191738 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Ocln-202ENSMUST00000069756 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 C2cd3-202ENSMUST00000098259 6602 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm26569-201ENSMUST00000181968 1789 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm28906-201ENSMUST00000191371 1779 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Plp1-201ENSMUST00000033800 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm25232-201ENSMUST00000104502 132 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Pex3-203ENSMUST00000105541 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm5228-201ENSMUST00000117186 357 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Cyp4a30-ps-201ENSMUST00000120813 1020 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm13012-202ENSMUST00000155349 849 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm22424-201ENSMUST00000158527 87 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Olfr457-201ENSMUST00000170504 1039 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Oas1h-202ENSMUST00000171820 931 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Gm5294J3QP53 Gm20379-201ENSMUST00000188317 1204 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms