Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 AC124103.1-201ENSMUST00000227564 1027 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Ugt2a3-201ENSMUST00000031195 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Grxcr1-201ENSMUST00000094715 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Gm13762-202ENSMUST00000168169 2180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Elk3-204ENSMUST00000151153 1336 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Luzp2-201ENSMUST00000082373 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Myo16-202ENSMUST00000207204 6719 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Gm43917-201ENSMUST00000191984 2360 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Ctxn3-201ENSMUST00000091892 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Tnfrsf23-202ENSMUST00000152703 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 A830036E02Rik-202ENSMUST00000128904 2768 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Ptpro-202ENSMUST00000167002 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Psma8-201ENSMUST00000040860 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Gm15704-201ENSMUST00000144757 2818 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Pkd1l3-201ENSMUST00000057344 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Arhgef9-207ENSMUST00000113885 4578 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Senp6-203ENSMUST00000165607 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Gm45534-201ENSMUST00000211449 2339 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Runx1t1-203ENSMUST00000098257 2332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Frrs1-201ENSMUST00000040260 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Prickle2-201ENSMUST00000032093 7754 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Cntnap2-205ENSMUST00000199100 6279 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Gm2163-201ENSMUST00000179734 2723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Gm45903-201ENSMUST00000212891 2898 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Kcnma1-203ENSMUST00000100831 3261 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Oacyl-201ENSMUST00000115097 3431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Pcdh15-225ENSMUST00000149977 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Olfr26-201ENSMUST00000104874 931 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Gm14180-201ENSMUST00000105066 78 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Gm4919-201ENSMUST00000117825 604 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Rps12-ps1-201ENSMUST00000121980 401 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Gm15345-201ENSMUST00000128240 663 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Nol12-205ENSMUST00000149580 646 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Gm16015-201ENSMUST00000154897 390 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Gm22408-201ENSMUST00000174925 65 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Gm27542-201ENSMUST00000184184 256 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Gm27185-201ENSMUST00000184296 247 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 2010308F09Rik-202ENSMUST00000186931 578 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Gm29144-201ENSMUST00000189235 339 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Gm29238-201ENSMUST00000189709 695 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Gm28607-201ENSMUST00000190142 339 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Gm28121-201ENSMUST00000191420 339 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Gm43542-201ENSMUST00000199505 379 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Gm19764-201ENSMUST00000203630 649 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Gm44245-201ENSMUST00000204304 232 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Gm43950-201ENSMUST00000204767 996 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Hddc3-209ENSMUST00000206480 454 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Gm46317-201ENSMUST00000221103 393 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 AC154785.1-201ENSMUST00000223280 572 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 AL590616.1-201ENSMUST00000223339 574 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Spink10-201ENSMUST00000055725 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Plec-203ENSMUST00000071869 14917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Rfwd3-201ENSMUST00000038739 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Olfr1315-ps1-203ENSMUST00000217078 1559 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Mtrf1-201ENSMUST00000022600 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Gm8728-201ENSMUST00000207367 2178 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Gm8486-201ENSMUST00000207508 2171 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Gm8685-201ENSMUST00000207567 2183 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Gm16443-201ENSMUST00000207909 2184 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Mtif2-201ENSMUST00000020749 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Cep112-216ENSMUST00000182729 2850 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Zfp946-201ENSMUST00000088763 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Ikbkg-202ENSMUST00000064407 4530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Wrn-204ENSMUST00000211498 4856 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Ctnnd1-220ENSMUST00000111694 6362 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Synj1-210ENSMUST00000170853 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Myo15-201ENSMUST00000071880 11769 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 4931406P16Rik-201ENSMUST00000085592 5798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Tirap-201ENSMUST00000175765 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Gm28497-201ENSMUST00000189646 3029 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Gm28403-201ENSMUST00000188743 2710 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Cnot2-204ENSMUST00000164088 2618 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Wdr20-201ENSMUST00000095410 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Gm7534-201ENSMUST00000097849 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Slmapos2-201ENSMUST00000160089 2194 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Plec-221ENSMUST00000171562 14944 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Plec-204ENSMUST00000072692 14944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Prpf4b-201ENSMUST00000077853 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Nasp-203ENSMUST00000081182 1461 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Phf11a-201ENSMUST00000062307 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Gm12535-201ENSMUST00000121025 484 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Gm24139-201ENSMUST00000122780 288 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Gm15668-201ENSMUST00000140506 678 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Gm16188-201ENSMUST00000142019 420 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atg3Q9CPX6 Gm24050-201ENSMUST00000158623 290 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms