Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm28122-201ENSMUST00000187088 615 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
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PtprtQ99M80 Gm28420-201ENSMUST00000187340 615 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
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PtprtQ99M80 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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PtprtQ99M80 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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PtprtQ99M80 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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PtprtQ99M80 Rabl3-201ENSMUST00000023524 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Map4k4-217ENSMUST00000195636 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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PtprtQ99M80 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Gm12970-201ENSMUST00000134911 581 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Gm8046-201ENSMUST00000172151 616 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
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