Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Olfr704-201ENSMUST00000080925 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SrrdQ8K2M3 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
SrrdQ8K2M3 AC158605.3-201ENSMUST00000218999 2538 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
SrrdQ8K2M3 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SrrdQ8K2M3 Trim43c-201ENSMUST00000163255 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SrrdQ8K2M3 Rgs4-201ENSMUST00000027991 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SrrdQ8K2M3 Olfr1254-203ENSMUST00000216587 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SrrdQ8K2M3 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SrrdQ8K2M3 Adgrf4-204ENSMUST00000170723 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SrrdQ8K2M3 CT010514.1-201ENSMUST00000214088 2969 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
SrrdQ8K2M3 Eri2-207ENSMUST00000150844 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Vmn2r53-201ENSMUST00000170412 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Ofcc1-201ENSMUST00000054635 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Trav12-1-201ENSMUST00000103650 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Gm24284-201ENSMUST00000104240 142 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Oprm1-217ENSMUST00000105615 1258 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Cisd3-202ENSMUST00000107584 546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Gm13742-201ENSMUST00000118805 457 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Gm10639-201ENSMUST00000119823 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Gm13964-201ENSMUST00000133815 734 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Tmsb10-204ENSMUST00000144337 433 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Gm13548-201ENSMUST00000144688 385 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Gm26351-201ENSMUST00000157532 232 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Gm24738-201ENSMUST00000158856 123 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Rpl29-ps1-201ENSMUST00000161849 508 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 U2af1l4-205ENSMUST00000163482 668 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Gm4302-201ENSMUST00000168769 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Mark1-ps3-201ENSMUST00000184922 694 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Gm3121-201ENSMUST00000187086 406 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Plet1-202ENSMUST00000188047 739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Gm29195-201ENSMUST00000189038 379 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Gm37392-201ENSMUST00000192098 516 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Gm36398-201ENSMUST00000192255 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Gm30312-201ENSMUST00000194516 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Cacnb2-216ENSMUST00000195841 503 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Gm42884-201ENSMUST00000200729 422 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Gm5314-201ENSMUST00000204852 466 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Hba-x-201ENSMUST00000020531 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Ceacam-ps1-201ENSMUST00000205380 794 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 5930435M05Rik-202ENSMUST00000207936 414 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Gm8804-201ENSMUST00000212292 798 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Gm3776-201ENSMUST00000217203 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 CT009556.3-201ENSMUST00000226173 513 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 AC124715.2-201ENSMUST00000226762 617 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Olfr735-201ENSMUST00000049729 1065 ntAPPRIS P2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Cldn34b2-201ENSMUST00000076671 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Olfr979-201ENSMUST00000080835 1045 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Gm10283-201ENSMUST00000093494 354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Prepl-201ENSMUST00000072406 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Gm9866-203ENSMUST00000182592 8487 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Dip2b-201ENSMUST00000023768 4323 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Acsl4-202ENSMUST00000112903 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Acsl4-203ENSMUST00000112904 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Sec31a-210ENSMUST00000182886 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Alkbh8-201ENSMUST00000053407 3603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Tctex1d1-202ENSMUST00000116317 1772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Gm37675-201ENSMUST00000192303 2847 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 AC138221.1-201ENSMUST00000216180 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Zfp791-201ENSMUST00000098550 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Rxfp1-201ENSMUST00000078527 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Casr-202ENSMUST00000114847 4303 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 1700112J16Rik-201ENSMUST00000181631 2215 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Wac-202ENSMUST00000092112 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Chrnb4-201ENSMUST00000034854 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Olfr97-206ENSMUST00000216225 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Atf7ip-201ENSMUST00000032335 8059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Gm45737-201ENSMUST00000208344 1612 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Gm32389-201ENSMUST00000209312 1621 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 1700074P13Rik-201ENSMUST00000031935 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Zfp473-201ENSMUST00000060270 3800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Acsl1-203ENSMUST00000110372 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Zfp740-203ENSMUST00000119800 3882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Ifit1bl2-202ENSMUST00000112463 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Lockd-201ENSMUST00000183867 5662 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Gm28444-201ENSMUST00000190777 2137 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Cux1-201ENSMUST00000004097 12862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Sipa1l1-201ENSMUST00000053969 7488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Ltn1-201ENSMUST00000039449 7737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Gm23484-201ENSMUST00000104178 131 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Gm23527-201ENSMUST00000104570 130 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Myl1-202ENSMUST00000119429 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Gm1947-201ENSMUST00000122451 910 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Gm16618-201ENSMUST00000134992 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Gm22202-201ENSMUST00000158608 311 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Zfp661-204ENSMUST00000164551 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Mir3085-201ENSMUST00000175493 89 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Gm20659-201ENSMUST00000176599 604 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Gm28266-201ENSMUST00000191410 439 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SrrdQ8K2M3 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms