Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Mterf1a-201ENSMUST00000044746 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Ptprr-201ENSMUST00000063470 3619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Sox6-206ENSMUST00000205405 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Ucp2-202ENSMUST00000126534 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Pbrm1-205ENSMUST00000112092 5009 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Olfr1491-202ENSMUST00000214007 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Olfr1491-203ENSMUST00000215493 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Olfr1491-205ENSMUST00000216377 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Zfp750-201ENSMUST00000092298 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Gm37245-201ENSMUST00000195137 2713 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Gm43258-201ENSMUST00000200312 1950 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Gm30165-201ENSMUST00000218769 1961 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Mill2-205ENSMUST00000227379 1998 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Nme8-201ENSMUST00000039340 1704 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Olfr554-203ENSMUST00000215995 2515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Vmn2r-ps96-201ENSMUST00000221218 2545 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Gpr50-201ENSMUST00000070449 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Ednra-201ENSMUST00000034029 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Gm37210-201ENSMUST00000192484 2004 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Kbtbd4-202ENSMUST00000111464 2343 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Cacna2d4-205ENSMUST00000186622 3710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Sipa1l1-201ENSMUST00000053969 7488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Gm22661-201ENSMUST00000104192 132 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Gm11433-201ENSMUST00000118318 228 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Rhox3g-201ENSMUST00000119965 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Gm40614-201ENSMUST00000125161 1254 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Gm12320-201ENSMUST00000127333 1182 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 1700025N21Rik-201ENSMUST00000160997 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Nup37-202ENSMUST00000169309 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Vmn2r-ps31-201ENSMUST00000176474 760 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Mir6930-201ENSMUST00000183859 68 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Gm28614-201ENSMUST00000186483 458 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Gm28888-201ENSMUST00000186556 316 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 2310005E17Rik-201ENSMUST00000186644 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Gm28652-201ENSMUST00000187008 599 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Gm21742-201ENSMUST00000189352 548 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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BB287469Q3UT53 Gm37026-201ENSMUST00000191917 535 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Gm37432-201ENSMUST00000195294 341 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 1700039M15Rik-201ENSMUST00000195377 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Gm43647-201ENSMUST00000198142 486 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Gm7565-201ENSMUST00000203611 623 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Olfr165-203ENSMUST00000206410 1040 ntAPPRIS P2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Gm6329-201ENSMUST00000209210 936 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 AC160338.2-201ENSMUST00000215508 281 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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BB287469Q3UT53 Tctex1d1-208ENSMUST00000223169 683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Tssk4-206ENSMUST00000228041 1217 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Apoc2-201ENSMUST00000003074 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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BB287469Q3UT53 Ttc16-201ENSMUST00000066478 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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BB287469Q3UT53 Vmn1r210-201ENSMUST00000072044 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Olfr641-201ENSMUST00000098183 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Pcdh11x-201ENSMUST00000050239 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Eif4enif1-201ENSMUST00000020734 3565 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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BB287469Q3UT53 Nf1-201ENSMUST00000071325 11917 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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BB287469Q3UT53 Zc2hc1c-201ENSMUST00000059341 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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BB287469Q3UT53 Adgrb3-201ENSMUST00000041838 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Naalad2-204ENSMUST00000166825 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Wdpcp-201ENSMUST00000020568 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Gm12430-201ENSMUST00000121539 1322 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Cyp2d12-201ENSMUST00000068861 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Rapgef6-210ENSMUST00000207429 5164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Hrh1-204ENSMUST00000161220 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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BB287469Q3UT53 Gm15577-201ENSMUST00000144350 2293 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 4930519E07Rik-201ENSMUST00000200907 1665 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Etl4-206ENSMUST00000114608 6635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Ppwd1-201ENSMUST00000022226 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Ppp2r3c-201ENSMUST00000021410 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Gsdmc-202ENSMUST00000173503 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Gm7203-201ENSMUST00000210880 1404 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Flrt3-201ENSMUST00000056760 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Slfn5-202ENSMUST00000108157 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Calhm2-202ENSMUST00000140512 3377 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Vps8-203ENSMUST00000115397 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Ppargc1a-205ENSMUST00000196968 2754 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Mirg-212ENSMUST00000183144 3797 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Fam214a-201ENSMUST00000081746 3795 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Slc12a6-201ENSMUST00000028549 6105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 AC113304.1-201ENSMUST00000214014 1833 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 CT009723.1-201ENSMUST00000215057 1803 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Slc18b1-201ENSMUST00000119597 2837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 4930402H05Rik-201ENSMUST00000203115 2829 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Olfr117-202ENSMUST00000213638 3183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
BB287469Q3UT53 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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