Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Mycbp2-201ENSMUST00000159855 15233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Cnga3-201ENSMUST00000027288 3554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Dgka-201ENSMUST00000026414 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Tg-201ENSMUST00000065916 8454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Il18bp-203ENSMUST00000209844 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Enpp3-203ENSMUST00000218044 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Mettl21e-201ENSMUST00000054801 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Strn-201ENSMUST00000024881 2967 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Dhx30-204ENSMUST00000196171 3885 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Prdm16-206ENSMUST00000105638 8601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Olfr1424-202ENSMUST00000207681 1714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Nod2-202ENSMUST00000109634 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 2700029L08Rik-201ENSMUST00000202895 1465 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 AC154634.1-201ENSMUST00000225225 2394 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 2810039B14Rik-204ENSMUST00000184801 2796 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Snap47-201ENSMUST00000010038 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Slc2a9-210ENSMUST00000155634 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Igsf5-203ENSMUST00000113794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Casp8-203ENSMUST00000190213 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm31267-201ENSMUST00000218941 1397 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Hsfy2-201ENSMUST00000062085 1392 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Ldb2-201ENSMUST00000070748 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Atf7ip-201ENSMUST00000032335 8059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Luc7l-202ENSMUST00000114976 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Rps6ka6-201ENSMUST00000065976 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Pet2-201ENSMUST00000113959 4183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Pet2-202ENSMUST00000113960 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Ints10-202ENSMUST00000070713 4192 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm4491-201ENSMUST00000159455 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 BB014433-203ENSMUST00000179941 1543 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Zkscan1-202ENSMUST00000066617 8042 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 4930511A02Rik-201ENSMUST00000181268 1935 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Tmem41b-203ENSMUST00000119929 2346 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Ces1e-201ENSMUST00000034173 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm4877-201ENSMUST00000104977 798 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 4933413L06Rik-201ENSMUST00000110292 809 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm8814-201ENSMUST00000119072 535 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm11260-201ENSMUST00000121163 942 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm11575-201ENSMUST00000122243 228 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm15247-201ENSMUST00000124513 403 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm16329-201ENSMUST00000148174 371 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Nhej1-201ENSMUST00000152855 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm2666-201ENSMUST00000160587 891 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Spanxn4-201ENSMUST00000172433 424 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm20508-201ENSMUST00000172480 487 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm21976-202ENSMUST00000180066 831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm26834-201ENSMUST00000181815 950 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gstp3-202ENSMUST00000189808 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm38149-201ENSMUST00000191943 339 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm8388-201ENSMUST00000193000 756 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm5150-202ENSMUST00000194367 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Rp1-202ENSMUST00000194992 858 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm43572-201ENSMUST00000196494 519 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm30557-201ENSMUST00000203764 349 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 D830044I16Rik-205ENSMUST00000206296 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm44576-201ENSMUST00000208876 411 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Il18-204ENSMUST00000214117 860 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Olfr915-201ENSMUST00000215191 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 AC153955.3-201ENSMUST00000216787 646 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 AC122301.1-201ENSMUST00000219625 507 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm9973-204ENSMUST00000221569 683 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm9973-205ENSMUST00000223449 849 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 AC153153.2-201ENSMUST00000223572 411 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 AC154706.1-201ENSMUST00000225482 585 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 AC150560.3-201ENSMUST00000227442 455 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Churc1-201ENSMUST00000041262 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm22054-201ENSMUST00000083395 155 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Olfr132-201ENSMUST00000087128 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Olfr1220-201ENSMUST00000099789 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Olfr1220-202ENSMUST00000099806 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm16239-201ENSMUST00000160182 2635 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Ube4bos1-201ENSMUST00000141259 2227 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gpr171-201ENSMUST00000085040 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Nedd4l-204ENSMUST00000224347 3150 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Synj2-209ENSMUST00000115790 4808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Il17rd-205ENSMUST00000226105 2923 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm38024-201ENSMUST00000192338 2532 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Pfkfb2-201ENSMUST00000050406 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Oprl1-202ENSMUST00000108763 2971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm42895-201ENSMUST00000200761 2996 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Patl2-201ENSMUST00000028665 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 AC155941.2-201ENSMUST00000218795 1861 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Npy5r-201ENSMUST00000070810 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Sept3-201ENSMUST00000023095 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm44749-201ENSMUST00000206285 1628 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Slc2a9-205ENSMUST00000129099 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms