Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc116-202ENSMUST00000115709 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Gtpbp6Q3U6U5 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 AC126251.1-201ENSMUST00000228170 2707 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
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Gtpbp6Q3U6U5 Tbx4-202ENSMUST00000108045 2959 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Tnfaip1-201ENSMUST00000017759 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Gtpbp6Q3U6U5 Rap1gds1-201ENSMUST00000029796 3383 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Gtpbp6Q3U6U5 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Tstd2-202ENSMUST00000107772 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gemin8-201ENSMUST00000056410 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Cst6-201ENSMUST00000025764 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Dhcr7-202ENSMUST00000124340 2556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Ssrp1-209ENSMUST00000168266 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 4631405J19Rik-202ENSMUST00000111270 2909 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc33-210ENSMUST00000215944 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp69-202ENSMUST00000106281 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Tprkb-205ENSMUST00000113753 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12538-201ENSMUST00000120064 486 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14394-201ENSMUST00000120307 295 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14383-201ENSMUST00000121637 386 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12751-201ENSMUST00000122336 381 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Snhg12-203ENSMUST00000128131 614 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms