Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 H2-Ea-ps-201ENSMUST00000134042 686 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm16267-201ENSMUST00000140569 732 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm13194-201ENSMUST00000142299 311 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm11695-201ENSMUST00000144230 407 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 2610035D17Rik-204ENSMUST00000150712 947 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm22000-201ENSMUST00000153087 730 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm24647-201ENSMUST00000157112 113 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm22014-201ENSMUST00000158785 290 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm18128-201ENSMUST00000172625 511 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm18354-201ENSMUST00000173515 1068 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm23283-201ENSMUST00000179362 110 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm26092-201ENSMUST00000179798 97 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Mir669a-1-201ENSMUST00000180238 97 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Fendrr-201ENSMUST00000181231 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Mir6912-201ENSMUST00000184456 70 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm28235-201ENSMUST00000185828 1120 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm29586-202ENSMUST00000186478 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm28969-204ENSMUST00000186554 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm28990-206ENSMUST00000190416 1136 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm29218-208ENSMUST00000191419 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm43247-201ENSMUST00000198638 481 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Zg16-202ENSMUST00000205424 682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Lnp1-201ENSMUST00000210579 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm45309-201ENSMUST00000211528 695 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Stmn1-rs1-201ENSMUST00000214793 462 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm45925-202ENSMUST00000219904 1136 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 4930555G21Rik-201ENSMUST00000221718 537 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 AC117814.1-201ENSMUST00000226135 352 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Mylpf-201ENSMUST00000032910 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Zg16-201ENSMUST00000051122 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm9770-201ENSMUST00000075147 811 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Olfr192-201ENSMUST00000080251 925 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 A630095E13Rik-201ENSMUST00000093868 619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm21541-201ENSMUST00000098128 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Olfr1043-201ENSMUST00000099907 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Sytl3-205ENSMUST00000160483 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Wdr89-202ENSMUST00000187307 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Mef2a-204ENSMUST00000107476 4759 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Spx-204ENSMUST00000211094 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Itgam-203ENSMUST00000106242 4649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Olfr329-ps-201ENSMUST00000108822 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Itgb1bp2-201ENSMUST00000033674 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Prkcd-208ENSMUST00000112211 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm5442-201ENSMUST00000202121 2034 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Trim2-201ENSMUST00000054990 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Vmn1r5-203ENSMUST00000228276 3188 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Tbccd1-201ENSMUST00000004576 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 4930435E12Rik-201ENSMUST00000122078 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Synrg-202ENSMUST00000092834 7115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 BC039771-202ENSMUST00000144661 2753 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 1700074P13Rik-201ENSMUST00000031935 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 CT025619.2-201ENSMUST00000216975 2312 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Ubap2l-208ENSMUST00000196843 3975 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Serpinc1-201ENSMUST00000064725 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gpr63-201ENSMUST00000038920 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gng7-202ENSMUST00000099462 3425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Zfhx3-201ENSMUST00000043896 16433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 4933423L19Rik-201ENSMUST00000208432 1464 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm36011-201ENSMUST00000208671 2719 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Ephb4-205ENSMUST00000166239 3741 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Ncoa3-201ENSMUST00000088095 7531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Dclk1-203ENSMUST00000167204 6025 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Ppip5k1-201ENSMUST00000052029 5533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Vps11-201ENSMUST00000034644 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Art4-201ENSMUST00000032341 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm10384-201ENSMUST00000100713 2046 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm3269-201ENSMUST00000166025 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm42601-201ENSMUST00000197025 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Tm4sf20-201ENSMUST00000027331 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm25593-201ENSMUST00000102272 96 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Ccl25-204ENSMUST00000110982 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Tex35-202ENSMUST00000118207 912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm12123-201ENSMUST00000120348 472 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm15465-201ENSMUST00000120368 358 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm12103-201ENSMUST00000121892 362 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm25845-201ENSMUST00000122588 310 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Mir2139-201ENSMUST00000158669 95 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Slc15a2-212ENSMUST00000168279 958 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Vmn1r-ps61-201ENSMUST00000173771 822 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Rbx1-ps-201ENSMUST00000173786 327 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm9399-201ENSMUST00000175771 639 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm21894-201ENSMUST00000179631 546 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm7863-201ENSMUST00000184700 805 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 1700022H16Rik-201ENSMUST00000188935 476 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm29041-201ENSMUST00000189199 380 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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