Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Nmnat1-202ENSMUST00000105693 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Spata48-202ENSMUST00000109678 753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm12354-201ENSMUST00000124319 554 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Tcp10a-204ENSMUST00000138222 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm12171-201ENSMUST00000150895 1257 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm26184-201ENSMUST00000157686 131 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm16334-201ENSMUST00000159488 694 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Aste1-204ENSMUST00000167674 1227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm20485-201ENSMUST00000174452 394 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Vmn2r-ps7-201ENSMUST00000176244 1098 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm18821-201ENSMUST00000184135 709 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Nuf2-203ENSMUST00000192248 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm37425-201ENSMUST00000193184 432 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Ighv5-1-201ENSMUST00000193324 353 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm38300-201ENSMUST00000194245 1870 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm43674-201ENSMUST00000196313 791 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Cdk2ap1-205ENSMUST00000196910 483 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Supt20-203ENSMUST00000197502 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm18901-201ENSMUST00000197840 1444 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm42767-201ENSMUST00000198583 632 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm42495-201ENSMUST00000200324 405 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm42576-201ENSMUST00000202336 2846 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm42903-201ENSMUST00000202607 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Rarres2-204ENSMUST00000204267 795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Rarres2-205ENSMUST00000204930 681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 4933432K03Rik-202ENSMUST00000206244 765 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm45204-201ENSMUST00000206297 1354 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm44649-202ENSMUST00000206896 635 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Rtp4-203ENSMUST00000210901 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 AC167017.1-201ENSMUST00000214975 412 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm33053-201ENSMUST00000215275 1144 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 1700027J07Rik-203ENSMUST00000217501 1884 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm46199-201ENSMUST00000220373 1693 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Fkbp3-202ENSMUST00000220730 579 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm7695-201ENSMUST00000220900 641 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 AC112259.1-201ENSMUST00000222891 853 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 AC165254.1-203ENSMUST00000222925 574 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Zfp389-202ENSMUST00000224437 1234 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Vmn1r37-206ENSMUST00000228791 1617 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gpr33-201ENSMUST00000040161 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Oard1-201ENSMUST00000046651 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Fgfbp1-201ENSMUST00000061299 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Dppa5a-201ENSMUST00000071991 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 1700010B08Rik-201ENSMUST00000073081 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm23037-201ENSMUST00000083874 324 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm3892-202ENSMUST00000178043 3539 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm10593-201ENSMUST00000178906 3539 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Armcx3-201ENSMUST00000081834 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 4930402H24Rik-201ENSMUST00000044766 6628 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Olfr1426-204ENSMUST00000219005 2507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 BC051077-201ENSMUST00000181440 2044 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Mmp27-201ENSMUST00000120900 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Fgg-201ENSMUST00000048486 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Tnip3-207ENSMUST00000212375 1543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 AC112265.1-201ENSMUST00000213522 1501 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm6468-201ENSMUST00000201076 1443 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 A830036E02Rik-202ENSMUST00000128904 2768 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm13456-201ENSMUST00000118928 1365 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Sdr16c5-201ENSMUST00000040925 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm38947-201ENSMUST00000209940 2720 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 AC153548.1-201ENSMUST00000219283 2661 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Hbq1b-201ENSMUST00000101387 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm23266-201ENSMUST00000104444 134 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 S100a16-204ENSMUST00000107333 608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Rfc4-203ENSMUST00000115338 1279 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm12391-201ENSMUST00000117626 282 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm12792-201ENSMUST00000117669 1019 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms