Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm9173-201ENSMUST00000198054 400 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Olfr1482-ps1-201ENSMUST00000207181 178 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm45672-201ENSMUST00000209700 768 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 4933409F18Rik-201ENSMUST00000221910 1267 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 AC156576.2-202ENSMUST00000222525 411 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm10748-202ENSMUST00000194396 2379 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Klhl10-201ENSMUST00000001599 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Fes-201ENSMUST00000080932 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Umodl1-203ENSMUST00000114555 5041 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Syt11-202ENSMUST00000107503 3575 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Rbm6-ps1-201ENSMUST00000186192 2870 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm232-201ENSMUST00000216549 2559 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm44417-201ENSMUST00000203298 3359 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm26874-201ENSMUST00000181959 1817 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm6116-201ENSMUST00000101121 1437 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm6721-201ENSMUST00000218353 1445 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Habp2-202ENSMUST00000095948 2815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm37084-201ENSMUST00000191688 5898 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Ctnnd1-218ENSMUST00000111692 6170 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 F730016J06Rik-203ENSMUST00000156508 2593 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Serpina3m-201ENSMUST00000101078 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 AC165080.1-201ENSMUST00000215257 3123 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm28138-201ENSMUST00000186250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm29270-201ENSMUST00000188071 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm29392-201ENSMUST00000189429 2167 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm29252-201ENSMUST00000189869 2167 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm29305-201ENSMUST00000191054 2167 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm2214-201ENSMUST00000121333 330 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 4930529I22Rik-201ENSMUST00000131509 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm13752-201ENSMUST00000138195 491 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Platr14-205ENSMUST00000146553 770 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 0610040B10Rik-201ENSMUST00000160231 501 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm16580-201ENSMUST00000162696 1044 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm17929-201ENSMUST00000186851 627 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Mrgprc7-ps-201ENSMUST00000187169 952 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm37565-201ENSMUST00000192277 491 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm43069-201ENSMUST00000201006 859 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm43440-201ENSMUST00000201957 729 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm45189-201ENSMUST00000208567 363 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 4930558N11Rik-204ENSMUST00000211512 516 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm39363-201ENSMUST00000214251 723 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 AC154552.4-201ENSMUST00000222171 151 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gm18631-201ENSMUST00000223125 1043 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 AC154335.1-201ENSMUST00000224744 395 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 AC167192.2-201ENSMUST00000224794 198 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 AC163646.1-201ENSMUST00000227704 397 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Olfr503-201ENSMUST00000078162 972 ntAPPRIS P2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 n-R5s79-201ENSMUST00000083071 120 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Ceacam11-201ENSMUST00000094799 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Rps6kc1-201ENSMUST00000061611 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Gk2-201ENSMUST00000059657 1880 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Ralgps1-204ENSMUST00000113165 6192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Nfrkb-201ENSMUST00000086167 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Asph-211ENSMUST00000108339 6453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Olfr1512-202ENSMUST00000214980 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Fadd-201ENSMUST00000033394 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Riok3Q9DBU3 Syt17-201ENSMUST00000081574 2764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms