Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprtQ99M80 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Rab44-201ENSMUST00000087942 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Foxn1-201ENSMUST00000108294 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Dhx30-219ENSMUST00000199529 4373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Gm13772-201ENSMUST00000118431 317 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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PtprtQ99M80 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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PtprtQ99M80 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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PtprtQ99M80 Gm26641-201ENSMUST00000181499 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Fgf6-201ENSMUST00000000187 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Gm42752-201ENSMUST00000198394 1106 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 9230114K14Rik-204ENSMUST00000199805 695 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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PtprtQ99M80 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 St5-202ENSMUST00000079282 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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PtprtQ99M80 Gpr152-201ENSMUST00000096338 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Itgam-202ENSMUST00000106240 3325 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Fam217a-202ENSMUST00000223834 2253 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Pde1c-204ENSMUST00000164752 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Mybbp1a-201ENSMUST00000045633 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
PtprtQ99M80 Slc9b2-201ENSMUST00000051849 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Tardbp-205ENSMUST00000105700 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
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PtprtQ99M80 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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PtprtQ99M80 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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PtprtQ99M80 Nat10-201ENSMUST00000028608 3879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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PtprtQ99M80 Olfr806-203ENSMUST00000215142 3108 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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PtprtQ99M80 Asb17-201ENSMUST00000044089 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Bank1-203ENSMUST00000196159 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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PtprtQ99M80 Gm28248-201ENSMUST00000186093 615 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Gm29633-202ENSMUST00000186217 615 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Gm28829-201ENSMUST00000186231 615 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Gm28261-201ENSMUST00000186417 615 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Gm28983-201ENSMUST00000186685 614 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Gm28815-201ENSMUST00000186751 615 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprtQ99M80 Gm28608-201ENSMUST00000186860 615 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
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