Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Zfand1-201ENSMUST00000037839 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Olfr152-202ENSMUST00000105210 2084 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Spen-201ENSMUST00000078886 12082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Fam60a-209ENSMUST00000203164 2442 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 4930533N22Rik-202ENSMUST00000206684 1503 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Rbm5-214ENSMUST00000182659 3205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Tcaf2-201ENSMUST00000031879 4497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Fmo5-203ENSMUST00000107050 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm15083-201ENSMUST00000138670 1413 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Mipol1-205ENSMUST00000145003 1424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm43255-201ENSMUST00000198885 1437 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Top3a-201ENSMUST00000002891 3741 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Dnm3-203ENSMUST00000159763 1305 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 AC135083.1-201ENSMUST00000227773 1331 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Snx32-201ENSMUST00000070172 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Dlk1-206ENSMUST00000109846 4106 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Daam1-202ENSMUST00000221317 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Zzz3-203ENSMUST00000106101 7539 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Rab2b-203ENSMUST00000167116 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm43526-201ENSMUST00000196666 1565 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Ctla4-201ENSMUST00000027164 1933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Olfr775-202ENSMUST00000214109 3598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Nbr1-201ENSMUST00000071537 3239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm29108-201ENSMUST00000186020 1498 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 AC165260.6-205ENSMUST00000224190 9762 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Wdcp-206ENSMUST00000223551 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm8326-201ENSMUST00000188705 1953 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Il1rl2-201ENSMUST00000095020 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Bag3-201ENSMUST00000033136 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Itih1-202ENSMUST00000163118 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Prpf6-201ENSMUST00000002529 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Tmem63c-201ENSMUST00000110187 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Rasgrf2-201ENSMUST00000099326 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Mageb2-201ENSMUST00000101397 1143 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm23659-201ENSMUST00000102245 110 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Trappc1-202ENSMUST00000102601 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm25422-201ENSMUST00000104219 129 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Rhox10-201ENSMUST00000115150 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm11199-201ENSMUST00000118691 507 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm12538-201ENSMUST00000120064 486 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm12202-201ENSMUST00000121196 811 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm9670-201ENSMUST00000121201 540 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm12161-201ENSMUST00000121454 361 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm12770-201ENSMUST00000121734 462 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Lrrc8dos-201ENSMUST00000135958 586 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm15092-201ENSMUST00000138467 574 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Ston1-207ENSMUST00000163588 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Rps24-202ENSMUST00000169826 519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 4921509A06Rik-201ENSMUST00000171278 392 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Olfr126-201ENSMUST00000174139 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm26092-201ENSMUST00000179798 97 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Mir669a-1-201ENSMUST00000180238 97 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm7693-201ENSMUST00000183257 988 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Mir7j-201ENSMUST00000184427 122 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm7654-201ENSMUST00000186738 683 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm28115-201ENSMUST00000188985 360 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm29323-201ENSMUST00000189792 332 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm7776-201ENSMUST00000191211 720 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm37756-201ENSMUST00000191834 942 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm17868-201ENSMUST00000192761 668 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm37550-201ENSMUST00000193230 463 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 1700023G09Rik-202ENSMUST00000194671 308 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm42622-201ENSMUST00000197229 355 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm42931-201ENSMUST00000201009 760 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 AC120011.1-201ENSMUST00000202147 744 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm45824-201ENSMUST00000212236 1004 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 AC167250.1-202ENSMUST00000213629 672 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Olfr572-202ENSMUST00000214096 1126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm34322-201ENSMUST00000214224 719 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 AC158531.1-201ENSMUST00000224617 457 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 AC165260.3-201ENSMUST00000225101 665 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 4930428N03Rik-205ENSMUST00000225654 892 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 AC122035.2-201ENSMUST00000228698 462 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Ang2-201ENSMUST00000051274 438 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Mageb1-201ENSMUST00000072269 1143 ntAPPRIS P2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm11567-201ENSMUST00000078442 1043 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm5499-201ENSMUST00000090731 885 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Olfr552-201ENSMUST00000098223 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm10719-201ENSMUST00000099047 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Mageb1-202ENSMUST00000099471 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Fmr1-202ENSMUST00000114653 4058 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm37178-201ENSMUST00000194962 1539 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Rpa1-202ENSMUST00000092907 5077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Cep63-211ENSMUST00000216281 1791 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm37570-201ENSMUST00000195411 3106 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Fam212b-201ENSMUST00000066610 4701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Nmnat2-201ENSMUST00000043313 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms