Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Gm37245-201ENSMUST00000195137 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Pou2f1-216ENSMUST00000184643 2201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Rfx2-202ENSMUST00000086801 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Cphx3-202ENSMUST00000184577 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Serpina3n-201ENSMUST00000021506 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Ccnb2-ps-202ENSMUST00000170898 2296 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Gm44624-201ENSMUST00000208700 2278 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Fbxl20-201ENSMUST00000103143 8601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LtbrP50284 Afap1l2-202ENSMUST00000118800 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Bag6-211ENSMUST00000173550 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Ednrb-201ENSMUST00000022718 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm38336-201ENSMUST00000193040 2549 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Bank1-205ENSMUST00000198206 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Mtmr4-202ENSMUST00000103179 5753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Il6st-203ENSMUST00000183663 8678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gpatch2-202ENSMUST00000065573 4547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm3055-201ENSMUST00000105316 720 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm9208-201ENSMUST00000120468 948 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm13877-201ENSMUST00000120614 417 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm12202-201ENSMUST00000121196 811 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm13440-201ENSMUST00000121665 496 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm8080-201ENSMUST00000122046 1155 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm11496-201ENSMUST00000128078 581 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm16330-201ENSMUST00000128324 297 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm13546-202ENSMUST00000138444 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Tvp23bos-201ENSMUST00000148598 1011 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm6483-201ENSMUST00000155660 862 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm26182-201ENSMUST00000157688 116 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Atp2b4-208ENSMUST00000167348 243 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm5839-201ENSMUST00000182835 1007 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Scgb1b1-ps-201ENSMUST00000189264 268 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Mir124-2hg-205ENSMUST00000189467 173 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm29491-201ENSMUST00000189481 506 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm37977-201ENSMUST00000193096 721 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm42938-201ENSMUST00000198414 1072 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm6227-201ENSMUST00000205237 421 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm2734-201ENSMUST00000208561 743 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 AC161424.1-201ENSMUST00000216969 666 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm35514-201ENSMUST00000221615 352 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm33467-201ENSMUST00000221885 652 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 AC207128.1-201ENSMUST00000225928 799 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Spats1-201ENSMUST00000024731 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Tas2r136-201ENSMUST00000065532 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Zfp781-201ENSMUST00000076281 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Entpd3-201ENSMUST00000047687 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Pi4ka-211ENSMUST00000154364 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Zp2-201ENSMUST00000033207 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm43528-201ENSMUST00000199492 1674 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Slc4a2-203ENSMUST00000115049 3924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm43154-206ENSMUST00000209562 1884 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Fgf13-202ENSMUST00000119306 2091 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Dhx30-215ENSMUST00000198425 3968 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Arid1a-201ENSMUST00000008024 6486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Zfp541-201ENSMUST00000108509 4561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm31898-201ENSMUST00000209232 1540 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Stau2-207ENSMUST00000131257 3616 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Parp11-203ENSMUST00000112193 1725 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Mgam2-ps-203ENSMUST00000216691 1709 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Nrp2-201ENSMUST00000027112 4216 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Sdhaf2-201ENSMUST00000025570 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Ak7-201ENSMUST00000040876 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm15169-202ENSMUST00000130794 2335 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Aoc1-204ENSMUST00000167529 2734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Dsg1a-201ENSMUST00000077146 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm44087-201ENSMUST00000204247 1770 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Il20rb-201ENSMUST00000098458 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Parpbp-201ENSMUST00000048518 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Rgs12-206ENSMUST00000114284 3624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm19445-201ENSMUST00000193649 2438 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm7444-201ENSMUST00000217455 2428 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Foxm1-202ENSMUST00000112148 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Ppp2r2b-201ENSMUST00000025377 2031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm37040-201ENSMUST00000191740 1824 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 4930510E17Rik-201ENSMUST00000034550 1639 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 F730016J06Rik-202ENSMUST00000128888 3699 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Ctnna2-201ENSMUST00000075340 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Slc25a45-201ENSMUST00000025732 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Fgd3-201ENSMUST00000048716 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm37091-201ENSMUST00000195455 2087 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm37702-201ENSMUST00000194357 1872 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 D030007L05Rik-201ENSMUST00000222964 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Echdc3-201ENSMUST00000042658 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Stk36-201ENSMUST00000087183 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Rbbp4-201ENSMUST00000102598 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm6787-201ENSMUST00000123120 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Olfr608-201ENSMUST00000213546 1482 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 1700015F17Rik-201ENSMUST00000115447 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm15779-201ENSMUST00000117470 412 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Rpl27-ps2-201ENSMUST00000120378 399 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm12317-201ENSMUST00000122307 319 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm12665-201ENSMUST00000126063 541 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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